More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3965 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3965  major facilitator transporter  100 
 
 		 413 aa  826    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.748751  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5307  major facilitator superfamily MFS_1  56.8 
 
 		 424 aa  494  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.535267  normal  0.123974 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3453  major facilitator superfamily MFS_1  57.21 
 
 		 420 aa  475  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  0.0945543 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1175  major facilitator superfamily MFS_1  53.73 
 
 		 419 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0759672  normal  0.955018 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1277  major facilitator transporter  34.67 
 
 		 410 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1550  major facilitator superfamily transporter  35.81 
 
 		 426 aa  252  8.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464954 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4255  Arabinose efflux permease-like protein  73.62 
 
 		 217 aa  250  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5135  major facilitator transporter  34.74 
 
 		 422 aa  243  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.203092 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0325  sugar efflux transporter  32.59 
 
 		 403 aa  233  6e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1077  major facilitator transporter  30.93 
 
 		 403 aa  230  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1090  major facilitator transporter  35.55 
 
 		 418 aa  230  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0155468 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3400  tranporter transmembrane protein  36.03 
 
 		 421 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3292  major facilitator superfamily MFS_1  35.38 
 
 		 439 aa  219  7e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3614  major facilitator superfamily MFS_1  35.09 
 
 		 439 aa  216  8e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2452  hypothetical protein  28.68 
 
 		 408 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.883759 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21230  catecholate siderophore efflux pump, MFS_1 family  28.09 
 
 		 407 aa  148  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000768503  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  25.58 
 
 		 398 aa  103  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2222  multidrug resistance protein  26.79 
 
 		 398 aa  99.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329957  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2183  multidrug resistance protein  25.13 
 
 		 400 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.532431  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0461  major facilitator superfamily MFS_1  22.5 
 
 		 420 aa  97.8  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19440  arabinose efflux permease family protein  22.78 
 
 		 421 aa  96.7  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.864683  normal  0.0256457 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2528  multidrug resistance protein  25.19 
 
 		 398 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0914  MFS transporter  30.16 
 
 		 395 aa  88.2  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4844  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 431 aa  87.8  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0085  major facilitator family transporter  26.49 
 
 		 390 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4885  major facilitator family transporter  26.12 
 
 		 390 aa  86.3  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00139132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4727  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 390 aa  86.3  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5128  major facilitator family transporter  26.12 
 
 		 390 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4742  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 394 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00912769  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 408 aa  86.3  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5260  major facilitator family transporter  26.12 
 
 		 414 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00289219  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5160  major facilitator family transporter  26.49 
 
 		 390 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5156  major facilitator family transporter  25.75 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1764  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  25.79 
 
 		 403 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  24.19 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5167  major facilitator family transporter  25.75 
 
 		 390 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2479  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000498746  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2528  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00311461  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1603  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 386 aa  82.8  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000182217  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0668  MFS transporter  25.66 
 
 		 387 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1145  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 436 aa  82  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.667647  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  28.06 
 
 		 388 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  28.06 
 
 		 388 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2559  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.71803  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06496  hypothetical protein  29.1 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  23.61 
 
 		 392 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1761  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.9 
 
 		 411 aa  80.1  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0377  arabinose efflux permease  30.53 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000232651  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 384 aa  79.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  25.56 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 401 aa  79.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  24.84 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04810  major facilitator superfamily MFS_1  22.86 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.332463  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0136  sugar efflux transporter  28.42 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0700  major facilitator superfamily transporter  28.74 
 
 		 394 aa  77  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  31.25 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 396 aa  76.6  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.46 
 
 		 565 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2036  major facilitator superfamily protein  28.99 
 
 		 392 aa  75.9  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.539709  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3250  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 386 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000228404 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  27.15 
 
 		 404 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 404 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1022  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 386 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  27.15 
 
 		 404 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0971  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 386 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  27.15 
 
 		 404 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  26.71 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1794  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 386 aa  75.5  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2073  sugar efflux transporter  24.1 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2006  putative multidrug resistance protein  26.63 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.88 
 
 		 495 aa  74.3  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0945  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1832  multidrug resistance protein  26.78 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.71931  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  26.82 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2038  putative multidrug resistance protein  26.78 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3423e-17 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6076  major facilitator transporter  24.85 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1862  multidrug resistance protein  26.78 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2004  multidrug resistance protein  26.78 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.627866  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3903  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.24 
 
 		 509 aa  73.9  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.753199  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2473  major facilitator superfamily MFS_1  22.87 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0269  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.8 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2117  putative multidrug resistance protein  26.23 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.521892  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  27.06 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.74 
 
 		 495 aa  73.2  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0515  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.26 
 
 		 520 aa  73.2  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6097  major facilitator transporter  22.68 
 
 		 406 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 385 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  27.81 
 
 		 683 aa  72.8  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  26.79 
 
 		 390 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  26.79 
 
 		 390 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0486  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.52 
 
 		 520 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.5834  normal  0.0840581 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3897  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 388 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 389 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 389 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>