More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3460 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3460  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 238 aa  480  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0108229  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09498  two-component system, transcriptional regulatory protein  84.55 
 
 		 236 aa  404  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0209  two component transcriptional regulator, winged helix family  73.5 
 
 		 251 aa  365  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1246  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.8 
 
 		 233 aa  267  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.877806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3651  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0435949 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0203  response regulator receiver  52.17 
 
 		 231 aa  229  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5387  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.29 
 
 		 236 aa  227  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1089  DNA-binding response regulator RprY  47.35 
 
 		 245 aa  222  4e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.414682 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4970  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 228 aa  201  6e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375881  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0856  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.99 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1242  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.29 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0255  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.41 
 
 		 232 aa  192  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03275  two-component system, transcriptional regulatory protein  42.49 
 
 		 234 aa  188  7e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3566  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 228 aa  187  9e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.720677 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5352  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.11 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1649  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 236 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0693  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.41 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.71 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519658 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2742  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.23 
 
 		 230 aa  181  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0346  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.81 
 
 		 234 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4521  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7053  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.03 
 
 		 248 aa  166  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00262574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2159  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.22 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00177162  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.84 
 
 		 223 aa  141  8e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1848  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.19 
 
 		 236 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0065624  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4388  DNA-binding response regulator  35.11 
 
 		 227 aa  138  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0673  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.45 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.996485  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  36.28 
 
 		 223 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  35.84 
 
 		 223 aa  136  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  35.84 
 
 		 223 aa  136  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3446  response regulator receiver  37.99 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.664648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  35.84 
 
 		 223 aa  136  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  35.84 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  35.84 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1151  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.56 
 
 		 225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  37.17 
 
 		 223 aa  135  8e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0625  two component transcriptional regulator  36.73 
 
 		 217 aa  135  8e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  37.17 
 
 		 223 aa  135  8e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03140  two component response regulator transcription regulator protein  33.05 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.249511  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  35.81 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  35.81 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  35.81 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03240  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  31.3 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.604152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  35.4 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1288  two component transcriptional regulator  31.44 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2180  DNA-binding response regulator  37.83 
 
 		 223 aa  132  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3593  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.24 
 
 		 226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000142937  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5471  two component transcriptional regulator  34.36 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00800002  hitchhiker  0.0013378 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1891  DNA-binding response regulator  37.83 
 
 		 223 aa  132  5e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0738  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.98 
 
 		 226 aa  132  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000482292  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2749  transcription response regulator-like protein  35.21 
 
 		 221 aa  132  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00061025  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  34.5 
 
 		 227 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0578  two component transcriptional regulator  31.44 
 
 		 240 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4650  DNA-binding response regulator  34.78 
 
 		 230 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3510  osmolarity response regulator  33.94 
 
 		 241 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0150  osmolarity response regulator  34.4 
 
 		 241 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001059  putative two-component response regulator  36.52 
 
 		 235 aa  131  7.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4433  DNA-binding response regulator  34.78 
 
 		 230 aa  131  9e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4777  DNA-binding response regulator  34.78 
 
 		 230 aa  131  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0421  two component transcriptional regulator  32.33 
 
 		 245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0518956  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4272  response regulator  34.78 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760233  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2316  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  30.6 
 
 		 230 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4297  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.47 
 
 		 243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.33 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.36 
 
 		 236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4185  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.47 
 
 		 243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.469867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0168  osmolarity response regulator  34.4 
 
 		 241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4662  DNA-binding response regulator  34.21 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0528  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.67 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0051  two component transcriptional regulator  33.19 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.480932 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  37.74 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1986  two component transcriptional regulator  33.91 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  35.09 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4665  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.06 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  0.209776 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1773  DNA-binding response regulator  35.81 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4647  DNA-binding response regulator  33.91 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2927  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.63 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3617  two component transcriptional regulator  34.45 
 
 		 221 aa  129  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0590  DNA-binding response regulator  33.91 
 
 		 230 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1631  two component transcriptional regulator  32.02 
 
 		 227 aa  129  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0039171  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2563  transcriptional regulatory protein ResD  33.77 
 
 		 221 aa  129  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00803163 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  33.49 
 
 		 241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0417  two component transcriptional regulator  31.88 
 
 		 228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1948  response regulator receiver domain-containing protein  35.5 
 
 		 226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2251  two component transcriptional regulator  32.14 
 
 		 240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4663  DNA-binding response regulator  33.91 
 
 		 230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4338  osmolarity response regulator  33.03 
 
 		 241 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4134  osmolarity response regulator  33.03 
 
 		 241 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4206  osmolarity response regulator  33.03 
 
 		 241 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  34.67 
 
 		 223 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3811  osmolarity response regulator  33.49 
 
 		 241 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0373241 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3817  two component transcriptional regulator  35.37 
 
 		 227 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000444115  decreased coverage  0.00121668 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3902  osmolarity response regulator  33.49 
 
 		 241 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.140952 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2476  two component transcriptional regulator  35.65 
 
 		 227 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.210757  normal  0.512741 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2337  two component heavy metal response transcriptional regulator  33.92 
 
 		 227 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0038  two component transcriptional regulator  32.47 
 
 		 228 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2941  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 652 aa  128  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  37.26 
 
 		 235 aa  129  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2729  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.48 
 
 		 228 aa  128  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981161  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  34.2 
 
 		 243 aa  128  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>