More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2371 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2371  Cl- channel, voltage-gated family protein  100 
 
 
418 aa  828    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.596743  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3539  Chloride channel core  52.01 
 
 
415 aa  413  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4094  Chloride channel core  51.41 
 
 
426 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.089965  normal  0.148511 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3981  Chloride channel core  51.41 
 
 
426 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1732  chloride channel core  50 
 
 
431 aa  395  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3703  Chloride channel core  48.64 
 
 
436 aa  391  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.474043  hitchhiker  0.000487156 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2302  Cl- channel, voltage gated  47.65 
 
 
413 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.191548  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01048  Cl- channel, voltage gated  46.53 
 
 
443 aa  382  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371868  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06118  Cl- channel, voltage gated  46.53 
 
 
443 aa  382  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12617  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1803  hypothetical protein  53.21 
 
 
431 aa  375  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0527819 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4570  Cl- channel, voltage gated  48.72 
 
 
413 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.615491  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3793  Cl- channel, voltage-gated family protein  48.72 
 
 
413 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258404  normal  0.231279 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3731  chloride channel core  48.72 
 
 
413 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.597122 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4619  voltage-gated chloride channel family protein  47.61 
 
 
452 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1486  Cl- channel, voltage gated  47.61 
 
 
448 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3685  chloride channel core  48.1 
 
 
468 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.36379  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0508  voltage-gated chloride channel  48.48 
 
 
435 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5519  Cl- channel, voltage-gated family protein  48.1 
 
 
413 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720023  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0545  Chloride channel core  46.84 
 
 
417 aa  365  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0459516  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0225  voltage-gated chloride channel  48.48 
 
 
427 aa  362  6e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0261  voltage-gated chloride channel  48.48 
 
 
427 aa  362  6e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1603  voltage-gated chloride channel  48.48 
 
 
436 aa  362  6e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845541  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1406  voltage-gated chloride channel  48.48 
 
 
427 aa  362  6e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0961  voltage-gated chloride channel  48.48 
 
 
435 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2677  chloride channel (ClC) family protein  48.22 
 
 
435 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267166  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4940  chloride channel core  47.99 
 
 
413 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.530885 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2064  chloride channel core  48.62 
 
 
440 aa  356  3.9999999999999996e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0178242 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2534  chloride channel (ClC) family protein  48.22 
 
 
435 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6970  Cl- channel voltage-gated family protein  42.66 
 
 
452 aa  311  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.06762  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0570  voltage-gated chloride channel family protein  39.95 
 
 
437 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0556  voltage gated chloride channel family protein  39.95 
 
 
437 aa  307  3e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4018  Chloride channel core  43.18 
 
 
453 aa  299  6e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2639  Chloride channel core  42.08 
 
 
457 aa  295  1e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.311853  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1136  hypothetical protein  41.56 
 
 
482 aa  294  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0839262  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0837  Cl- channel, voltage-gated family protein  41.69 
 
 
462 aa  281  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.115914  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1026  chloride channel core  44.12 
 
 
421 aa  247  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.724519  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2367  Chloride channel core  36.87 
 
 
438 aa  217  4e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1199  chloride channel protein EriC  33.16 
 
 
403 aa  211  1e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00235154  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2180  Cl- channel, voltage gated  36.11 
 
 
435 aa  208  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000426596  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0541  voltage-gated chloride channel family protein  37.11 
 
 
398 aa  206  6e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1145  chloride channel protein EriC  34.29 
 
 
408 aa  186  9e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000190492  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2620  Cl- channel voltage-gated family protein  31.12 
 
 
452 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285702  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0292  chloride channel core protein  30.89 
 
 
455 aa  170  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.158347  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0274  Chloride channel core  30.56 
 
 
455 aa  169  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3273  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.05 
 
 
481 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1160  chloride channel core  34 
 
 
494 aa  150  5e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  26.95 
 
 
598 aa  116  7.999999999999999e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  25.8 
 
 
462 aa  110  3e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  28.08 
 
 
586 aa  107  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2090  Cl- channel, voltage gated  27.01 
 
 
434 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0263619  hitchhiker  0.00000244814 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  25.81 
 
 
606 aa  107  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.57 
 
 
591 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1953  Chloride channel core  26.32 
 
 
429 aa  103  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0629221  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13300  chloride channel protein EriC  24.87 
 
 
414 aa  99.8  9e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.08 
 
 
577 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.51 
 
 
754 aa  97.8  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.46 
 
 
579 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  27.79 
 
 
582 aa  95.5  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.46 
 
 
579 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.46 
 
 
579 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.7 
 
 
636 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.54 
 
 
598 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.28 
 
 
628 aa  94  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1071  hypothetical protein  27.37 
 
 
457 aa  90.1  7e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.25 
 
 
594 aa  89.7  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1362  Chloride channel core  27.64 
 
 
393 aa  89  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00220045  normal  0.308625 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1543  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.97 
 
 
582 aa  89  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.445538 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.68 
 
 
580 aa  88.6  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.21 
 
 
612 aa  88.2  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.3 
 
 
589 aa  87.4  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4402  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.78 
 
 
598 aa  87  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0824696  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1241  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.28 
 
 
428 aa  87.4  5e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.730218 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.79 
 
 
560 aa  87  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1979  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.1 
 
 
426 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.78 
 
 
593 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.39 
 
 
591 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1867  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.1 
 
 
414 aa  84.7  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.396231  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.78 
 
 
593 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.78 
 
 
589 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.01 
 
 
589 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.01 
 
 
589 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  29.38 
 
 
602 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1443  Cl- channel, voltage gated  35.33 
 
 
638 aa  83.2  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4920  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.06 
 
 
426 aa  82.8  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2504  Chloride channel core  35.81 
 
 
634 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.244911  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2417  chloride channel core protein  35.81 
 
 
612 aa  81.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0630  Chloride channel core  29.43 
 
 
475 aa  81.3  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0357  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.42 
 
 
588 aa  80.9  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  26.23 
 
 
528 aa  80.1  0.00000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  26.82 
 
 
613 aa  79.7  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4536  Chloride channel core  26.46 
 
 
603 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143283 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2453  Cl- channel voltage-gated family protein  29.77 
 
 
605 aa  79  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  26.45 
 
 
614 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  28.94 
 
 
584 aa  78.2  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  26.49 
 
 
585 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5286  Chloride channel core  26.22 
 
 
431 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  28.48 
 
 
456 aa  78.2  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  25.06 
 
 
604 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.05 
 
 
582 aa  77.8  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0552  Chloride channel core  27.27 
 
 
614 aa  78.2  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>