107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1104 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1104  lipid A biosynthesis acyltransferase  100 
 
 
292 aa  595  1e-169  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0549  lipid A biosynthesis acyltransferase  61.72 
 
 
299 aa  383  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.3206  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03895  hypothetical protein  59.03 
 
 
290 aa  355  6.999999999999999e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1857  lipid A biosynthesis acyltransferase  48.46 
 
 
296 aa  293  3e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2122  acyltransferase  41.61 
 
 
298 aa  245  8e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.946895  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1995  lipid A biosynthesis acyltransferase  40.34 
 
 
288 aa  226  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.834184  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0434  hypothetical protein  26.09 
 
 
315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.037729  normal  0.512971 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03733  xanthomonadin biosynthesis acyltransferase  27.15 
 
 
324 aa  117  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0922  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.3 
 
 
300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0478  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.37 
 
 
299 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0319  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.06 
 
 
320 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.362183  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0307  hypothetical protein  26.73 
 
 
320 aa  105  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0917  hypothetical protein  23.93 
 
 
315 aa  104  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2652  acyltransferase  26.35 
 
 
303 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
567 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5098  hypothetical protein  22.71 
 
 
315 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  25.56 
 
 
610 aa  102  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0432  hypothetical protein  22.92 
 
 
315 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  25.88 
 
 
610 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0943  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.34 
 
 
306 aa  101  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  25.24 
 
 
606 aa  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2748  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  25 
 
 
310 aa  100  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252016  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1376  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.58 
 
 
326 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227614  hitchhiker  0.00151708 
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  24.26 
 
 
567 aa  99.4  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0800  hypothetical protein  25.8 
 
 
282 aa  99  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4383  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.99 
 
 
343 aa  98.2  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0399697  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.08 
 
 
552 aa  98.6  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.96 
 
 
594 aa  97.4  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2067  acyltransferase  25.25 
 
 
326 aa  97.1  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  24.35 
 
 
567 aa  96.3  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  24.84 
 
 
568 aa  95.9  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1990  acyltransferase  25.42 
 
 
326 aa  95.5  8e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.186271  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0431  hypothetical protein  28.57 
 
 
323 aa  95.1  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.691434  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  23.86 
 
 
629 aa  94.7  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  23.78 
 
 
619 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  23.36 
 
 
573 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  23.87 
 
 
623 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  23.36 
 
 
573 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2814  acyltransferase-like protein  26.83 
 
 
324 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  23.38 
 
 
619 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  24.34 
 
 
572 aa  93.2  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  23.7 
 
 
619 aa  92.8  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2681  acyltransferase-like protein  27.44 
 
 
324 aa  92.8  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640182  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  24.68 
 
 
593 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  23.92 
 
 
575 aa  92.8  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  22.92 
 
 
572 aa  92.8  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  23.59 
 
 
575 aa  92.4  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  24.33 
 
 
563 aa  91.7  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2148  acyltransferase-like  25.17 
 
 
327 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2762  acyltransferase-like protein  25.17 
 
 
327 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00399604  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1320  hypothetical protein  24.41 
 
 
321 aa  91.3  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0066  lipid A biosynthesis acyltransferase  25 
 
 
314 aa  90.9  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3299  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  24.08 
 
 
334 aa  90.5  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.921474  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0117  acyltransferase  25.36 
 
 
306 aa  90.1  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000125573  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6092  acyltransferase-like  25.26 
 
 
327 aa  89.4  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436764  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.78 
 
 
536 aa  89.7  6e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4175  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  25.66 
 
 
301 aa  89  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  23.68 
 
 
606 aa  88.6  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  23.26 
 
 
585 aa  88.6  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3931  hypothetical protein  22.3 
 
 
323 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.959639  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.84 
 
 
535 aa  87.4  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  22.71 
 
 
558 aa  87  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2753  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.15 
 
 
324 aa  85.9  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602528  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3613  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.34 
 
 
300 aa  85.9  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0243  hypothetical protein  27.16 
 
 
299 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  23.57 
 
 
571 aa  83.2  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2207  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.16 
 
 
302 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  22.26 
 
 
568 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  22.26 
 
 
568 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2099  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.87 
 
 
287 aa  79.3  0.00000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3989  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.45 
 
 
304 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0435  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.7 
 
 
320 aa  78.6  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.646584  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3918  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.1 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  22.07 
 
 
563 aa  72.8  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1688  hypothetical protein  29.56 
 
 
297 aa  72  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.426385  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1962  acyltransferase, putative  22.73 
 
 
304 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.313582  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2672  hypothetical protein  22.3 
 
 
332 aa  65.9  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.258257  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2621  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.89 
 
 
305 aa  57.4  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75947  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1483  acyltransferase  24.47 
 
 
307 aa  57  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0369  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.56 
 
 
302 aa  55.8  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1563  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.53 
 
 
281 aa  54.7  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.37 
 
 
301 aa  54.7  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1120  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.5 
 
 
310 aa  54.3  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0306  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.83 
 
 
298 aa  53.1  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000601508  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.68 
 
 
301 aa  50.8  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14960  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.91 
 
 
307 aa  50.4  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3056  lipid A biosynthesis acyltransferase  20.5 
 
 
315 aa  48.9  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.605153 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0365  lipid A biosynthesis acyltransferase  20.16 
 
 
291 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0338088 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2901  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.69 
 
 
284 aa  48.5  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0182  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase, putative  33.82 
 
 
295 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2358  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.68 
 
 
284 aa  45.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2280  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase (heat shock protein)  25.27 
 
 
307 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3230  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.13 
 
 
318 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0207  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.59 
 
 
331 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000206716 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2870  hypothetical protein  23.67 
 
 
278 aa  43.9  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1802  acyltransferase  24.27 
 
 
306 aa  43.9  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482344 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18900  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.76 
 
 
289 aa  43.9  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0014  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  32.35 
 
 
295 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0012  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.07 
 
 
295 aa  43.5  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00360143  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0480  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  24.6 
 
 
317 aa  43.5  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.182596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>