More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2706 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2706  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
538 aa  1113    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723031  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3371  extracellular solute-binding protein family 5  66.67 
 
 
536 aa  748    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4044  extracellular solute-binding protein family 5  67.48 
 
 
536 aa  771    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3537  extracellular solute-binding protein  56.74 
 
 
556 aa  654    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3867  extracellular solute-binding protein family 5  67.48 
 
 
536 aa  774    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3248  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein, putative  54.94 
 
 
540 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1878  extracellular solute-binding protein  56.55 
 
 
536 aa  591  1e-167  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1880  extracellular solute-binding protein  52.65 
 
 
536 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.70178  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5173  extracellular solute-binding protein family 5  36.83 
 
 
528 aa  356  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12226  normal  0.127243 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5442  extracellular solute-binding protein family 5  36.78 
 
 
528 aa  352  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0169825 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1878  extracellular solute-binding protein family 5  37.96 
 
 
531 aa  351  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.558624  normal  0.335683 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1692  extracellular solute-binding protein family 5  37.92 
 
 
531 aa  347  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122173  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4180  extracellular solute-binding protein family 5  36.16 
 
 
547 aa  347  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336386  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3852  extracellular solute-binding protein family 5  36.35 
 
 
547 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3829  extracellular solute-binding protein  36.79 
 
 
569 aa  335  9e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.847313 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0038  extracellular solute-binding protein  34.43 
 
 
532 aa  332  9e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.216937  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1906  extracellular solute-binding protein  35.89 
 
 
543 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0377443  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3888  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  33.09 
 
 
550 aa  324  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.799639  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2326  extracellular solute-binding protein  35.21 
 
 
546 aa  322  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.294702  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2465  extracellular solute-binding protein  34.6 
 
 
529 aa  320  5e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3528  extracellular solute-binding protein  33.65 
 
 
564 aa  312  7.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.61993  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1248  extracellular solute-binding protein  32.08 
 
 
537 aa  311  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.710714 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3088  extracellular solute-binding protein  33.88 
 
 
538 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902972  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3993  extracellular solute-binding protein family 5  35.64 
 
 
531 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0372  extracellular solute-binding protein  35.19 
 
 
529 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132597  normal  0.149219 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0807  ABC dipeptide transporter, substrate-binding subunit DdpA  34.79 
 
 
538 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123514  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0135  extracellular solute-binding protein family 5  33.61 
 
 
531 aa  291  3e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1917  extracellular solute-binding protein  32.95 
 
 
518 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2713  extracellular solute-binding protein  33.87 
 
 
529 aa  288  1e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1030  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  31.98 
 
 
534 aa  286  7e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.180664  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4479  extracellular solute-binding protein  36.13 
 
 
533 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.027731  normal  0.668994 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3777  extracellular solute-binding protein  36.13 
 
 
533 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4591  extracellular solute-binding protein  36.13 
 
 
533 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140228  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2047  extracellular solute-binding protein  34.62 
 
 
529 aa  283  4.0000000000000003e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.101703  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1253  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  36.33 
 
 
533 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0799  extracellular solute-binding protein  34.57 
 
 
531 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162067  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4004  extracellular solute-binding protein  36.16 
 
 
535 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4017  extracellular solute-binding protein  35.93 
 
 
533 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0465332  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5714  extracellular solute-binding protein  35.8 
 
 
533 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4061  extracellular solute-binding protein  34.65 
 
 
529 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.707761  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7644  extracellular solute-binding protein  33.4 
 
 
528 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.938913  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4012  extracellular solute-binding protein  34.8 
 
 
529 aa  274  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0256267  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4474  extracellular solute-binding protein  34.8 
 
 
529 aa  274  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0385001  normal  0.989495 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0197  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35.9 
 
 
535 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415604  normal  0.0839796 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4056  extracellular solute-binding protein  36.38 
 
 
489 aa  270  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6301  extracellular solute-binding protein family 5  35.29 
 
 
535 aa  269  7e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5720  extracellular solute-binding protein  33.94 
 
 
529 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174819  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3783  extracellular solute-binding protein  33.94 
 
 
529 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.44101  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4585  extracellular solute-binding protein  33.94 
 
 
529 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1427  solute-binding family 5 protein  34.14 
 
 
533 aa  265  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1258  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  33.73 
 
 
543 aa  265  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1274  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.4 
 
 
533 aa  264  4e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834925  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2562  periplasmic solute-binding protein  33.4 
 
 
533 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1392  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.4 
 
 
533 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00928392  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1050  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.4 
 
 
533 aa  264  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0247  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.4 
 
 
533 aa  264  4e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.279993  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0518  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.4 
 
 
533 aa  264  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.886694  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1442  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.28 
 
 
563 aa  263  6e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.663118  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1311  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.4 
 
 
533 aa  263  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251362  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0232  solute-binding family 5 protein  34.33 
 
 
530 aa  261  3e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.79785  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1261  solute-binding family 5 protein  34.33 
 
 
530 aa  260  4e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.24251  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2574  solute-binding family 5 protein  34.33 
 
 
530 aa  260  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1329  solute-binding family 5 protein  34.33 
 
 
530 aa  260  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1065  solute-binding family 5 protein  34.33 
 
 
530 aa  260  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0504  solute-binding family 5 protein  34.33 
 
 
530 aa  260  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3198  extracellular solute-binding protein  33.8 
 
 
547 aa  256  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271789  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1410  solute-binding family 5 protein  34.06 
 
 
530 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2916  4-phytase  30.06 
 
 
522 aa  251  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2056  extracellular solute-binding protein  30.41 
 
 
521 aa  238  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149494  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3686  extracellular solute-binding protein  30.23 
 
 
522 aa  235  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3551  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, periplasmic dipeptide/oligopeptide/nickel-binding protein  30.23 
 
 
522 aa  235  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3741  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 
532 aa  233  8.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2911  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 
524 aa  230  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.628741  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2532  extracellular solute-binding protein family 5  32.45 
 
 
525 aa  226  7e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1105  extracellular solute-binding protein  28.83 
 
 
522 aa  223  8e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1799  extracellular solute-binding protein family 5  28.49 
 
 
531 aa  221  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0907769  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0925  extracellular solute-binding protein family 5  31.64 
 
 
523 aa  221  3.9999999999999997e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.30323 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0553  extracellular solute-binding protein  29.7 
 
 
522 aa  217  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.727867  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1763  extracellular solute-binding protein family 5  28.24 
 
 
536 aa  213  7.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  28.76 
 
 
516 aa  178  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  28.94 
 
 
516 aa  177  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 
516 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  29.11 
 
 
516 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  28.76 
 
 
516 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  28.76 
 
 
516 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  28.57 
 
 
516 aa  171  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 
516 aa  171  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  25.19 
 
 
534 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  28.22 
 
 
532 aa  169  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7015  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.77 
 
 
528 aa  166  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0208042  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  26.84 
 
 
524 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  26.94 
 
 
515 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  28.15 
 
 
520 aa  162  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  25.69 
 
 
535 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  27.29 
 
 
532 aa  162  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  26.12 
 
 
521 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  25.93 
 
 
521 aa  156  7e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.93 
 
 
521 aa  156  7e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  25.93 
 
 
521 aa  156  7e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 
521 aa  156  7e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>