More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0197 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0197  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 
437 aa  900    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4113  excinuclease ABC C subunit domain protein  40.6 
 
 
465 aa  271  1e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1011  excinuclease ABC, C subunit  36.99 
 
 
479 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1156  excinuclease ABC subunit C  36.7 
 
 
510 aa  218  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1237  excinuclease ABC C subunit domain protein  32.07 
 
 
498 aa  203  5e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.173931  normal  0.435946 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  41.08 
 
 
628 aa  182  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  38.49 
 
 
615 aa  180  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  39.45 
 
 
591 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  41.15 
 
 
620 aa  176  8e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  37.65 
 
 
625 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  40.74 
 
 
620 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  36.69 
 
 
615 aa  171  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  37.98 
 
 
607 aa  170  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  38.17 
 
 
601 aa  169  7e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  36.4 
 
 
685 aa  168  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  36.96 
 
 
613 aa  167  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  37.01 
 
 
590 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  37.01 
 
 
591 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  36.72 
 
 
614 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1749  excinuclease ABC subunit C  37.86 
 
 
527 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0671774  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  39.09 
 
 
613 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  35.86 
 
 
613 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1044  excinuclease ABC, C subunit  38.11 
 
 
616 aa  164  3e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00420676  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  34.3 
 
 
593 aa  164  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  34.3 
 
 
593 aa  164  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1252  excinuclease ABC, C subunit  36.33 
 
 
647 aa  163  5.0000000000000005e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1145  excinuclease ABC, C subunit  37.6 
 
 
594 aa  163  7e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02086  excinuclease ABC subunit C  37.75 
 
 
544 aa  162  8.000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000899057  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  33.98 
 
 
594 aa  161  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  36.67 
 
 
619 aa  161  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  37.08 
 
 
598 aa  160  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  36.1 
 
 
593 aa  160  5e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1544  excinuclease ABC, C subunit  35.52 
 
 
659 aa  160  5e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1161  excinuclease ABC subunit C  37.4 
 
 
520 aa  159  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.342266  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  39.09 
 
 
596 aa  158  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1947  excinuclease ABC, C subunit  35.8 
 
 
670 aa  159  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122446  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  34.58 
 
 
627 aa  159  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  36.99 
 
 
609 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  37.4 
 
 
599 aa  158  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  35.41 
 
 
644 aa  157  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0657  excinuclease ABC subunit C  34.17 
 
 
603 aa  158  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000040695  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0871  excinuclease ABC subunit C  34.3 
 
 
600 aa  158  2e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3221  excinuclease ABC, C subunit  33.47 
 
 
602 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.0605848 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  37.45 
 
 
594 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  37.11 
 
 
611 aa  157  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1733  excinuclease ABC, C subunit  30.38 
 
 
610 aa  157  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110405  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  36.68 
 
 
594 aa  157  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1270  excinuclease ABC subunit C  30.38 
 
 
610 aa  156  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000021646  hitchhiker  0.000709379 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  37.92 
 
 
638 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1726  excinuclease ABC subunit C  30.38 
 
 
610 aa  156  6e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000100265  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  34.59 
 
 
607 aa  156  6e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  37.07 
 
 
594 aa  156  7e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  37.07 
 
 
594 aa  156  7e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  37.07 
 
 
594 aa  156  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2685  excinuclease ABC subunit C  30.38 
 
 
610 aa  156  7e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000130785  normal  0.0663039 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2146  excinuclease ABC subunit C  30.38 
 
 
610 aa  156  7e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000023615  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0024  excinuclease ABC subunit C  34.68 
 
 
596 aa  156  7e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  37.07 
 
 
594 aa  156  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2011  excinuclease ABC subunit C  30.38 
 
 
610 aa  156  7e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000678771  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  37.07 
 
 
594 aa  156  7e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  38.75 
 
 
617 aa  156  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  38.75 
 
 
617 aa  156  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  35.56 
 
 
616 aa  156  9e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  35.43 
 
 
593 aa  155  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  37.07 
 
 
594 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0845  excinuclease ABC, C subunit  36.26 
 
 
620 aa  155  1e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.866518  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15160  Excinuclease ABC subunit C  35.69 
 
 
650 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0854  excinuclease ABC subunit C  35.21 
 
 
526 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149188  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3337  excinuclease ABC subunit C  38.06 
 
 
660 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0998705  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  37.07 
 
 
594 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1954  excinuclease ABC subunit C  34.77 
 
 
609 aa  155  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00983646  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2449  excinuclease ABC subunit C  37.3 
 
 
608 aa  155  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0823614  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0520  excinuclease ABC subunit C  35.66 
 
 
599 aa  155  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.545432  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  34.12 
 
 
631 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  36.78 
 
 
607 aa  155  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0902  excinuclease ABC subunit C  35.97 
 
 
658 aa  154  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.839452  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  36.29 
 
 
594 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1040  excinuclease ABC subunit C  30.13 
 
 
610 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000190411  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  37.6 
 
 
614 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1174  excinuclease ABC subunit C  30.63 
 
 
610 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000294093  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  34.82 
 
 
625 aa  154  4e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2478  excinuclease ABC, C subunit  38.6 
 
 
652 aa  154  4e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.446818  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2102  excinuclease ABC subunit C  30.63 
 
 
610 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000495467  normal  0.0150424 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1297  excinuclease ABC subunit C  30.63 
 
 
610 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000512015  hitchhiker  0.00000387597 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  33 
 
 
622 aa  153  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  36.89 
 
 
612 aa  153  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1849  excinuclease ABC subunit C  29.11 
 
 
610 aa  153  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109871  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  38.4 
 
 
624 aa  153  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2220  excinuclease ABC subunit C  39.08 
 
 
639 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0021269  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0158  excinuclease ABC subunit C  34.83 
 
 
527 aa  153  7e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  36.8 
 
 
708 aa  153  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  35.95 
 
 
607 aa  152  8e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04670  excinuclease ABC, C subunit  34.94 
 
 
598 aa  152  8e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1073  excinuclease ABC subunit C  35.48 
 
 
607 aa  152  8e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  34.96 
 
 
610 aa  152  8e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0726  excinuclease ABC subunit C  36.36 
 
 
597 aa  152  8.999999999999999e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2109  excinuclease ABC subunit C  30.38 
 
 
610 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0217985  hitchhiker  0.00000000000000291711 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2276  excinuclease ABC, C subunit  36.25 
 
 
644 aa  152  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1854  excinuclease ABC subunit C  35.14 
 
 
574 aa  151  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.971322  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  36.36 
 
 
607 aa  151  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>