More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2558 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_05070  Recombination protein MgsA  75.92 
 
 		 435 aa  667    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.395442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2558  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 446 aa  909    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0452  AAA ATPase central domain protein  72.21 
 
 		 443 aa  637    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07770  Recombination protein MgsA  75.06 
 
 		 446 aa  675    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.138045 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  50.22 
 
 		 450 aa  421  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  51.53 
 
 		 441 aa  414  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  50.36 
 
 		 438 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  52.08 
 
 		 435 aa  404  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3088  AAA ATPase central domain protein  54.59 
 
 		 456 aa  404  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00871  recombination factor protein RarA  45.49 
 
 		 455 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0752794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  47.76 
 
 		 447 aa  397  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  51.66 
 
 		 432 aa  395  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  50 
 
 		 731 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5272  recombination factor protein RarA  49.66 
 
 		 448 aa  395  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2081  recombination factor protein RarA  52.94 
 
 		 441 aa  393  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  47.85 
 
 		 739 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  51.76 
 
 		 463 aa  393  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02651  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  49.42 
 
 		 735 aa  395  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  47.31 
 
 		 441 aa  394  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2050  AAA ATPase central domain-containing protein  52.62 
 
 		 436 aa  392  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  49.52 
 
 		 437 aa  393  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  51.16 
 
 		 441 aa  391  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  51.2 
 
 		 435 aa  389  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  50.12 
 
 		 461 aa  390  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2010  AAA ATPase central domain protein  53.37 
 
 		 484 aa  385  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105628  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  52.66 
 
 		 440 aa  386  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0388  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  49.3 
 
 		 733 aa  387  1e-106  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2304  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  49.42 
 
 		 721 aa  387  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.320416 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  51.81 
 
 		 435 aa  388  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  49.14 
 
 		 446 aa  386  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3161  AAA ATPase central domain protein  48.75 
 
 		 445 aa  382  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  49.64 
 
 		 447 aa  382  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01421  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  48.56 
 
 		 734 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.869861  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  50.86 
 
 		 456 aa  381  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  47.87 
 
 		 431 aa  379  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1441  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  48.56 
 
 		 734 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.641024  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  48.63 
 
 		 485 aa  379  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  48.12 
 
 		 726 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  50.24 
 
 		 422 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  50.12 
 
 		 458 aa  381  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  48.67 
 
 		 441 aa  375  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  46.48 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3309  AAA ATPase central domain protein  50.6 
 
 		 494 aa  378  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000347883  normal  0.0560035 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6097  recombination factor protein RarA  50.57 
 
 		 436 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  47.65 
 
 		 440 aa  377  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  50.59 
 
 		 447 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  48.41 
 
 		 453 aa  375  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3217  recombination factor protein RarA  49.2 
 
 		 519 aa  372  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0809903  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  49.3 
 
 		 434 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  51.7 
 
 		 448 aa  372  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  47.8 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1333  recombination factor protein RarA  47.45 
 
 		 500 aa  369  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.272452  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  48.22 
 
 		 446 aa  371  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  50.35 
 
 		 505 aa  371  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  48.59 
 
 		 434 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0141  ATPase central domain-containing protein  47.55 
 
 		 416 aa  365  1e-99  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1356  AAA ATPase central domain protein  50.82 
 
 		 464 aa  364  2e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.873359 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  48.39 
 
 		 444 aa  363  3e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  47.71 
 
 		 457 aa  362  5.0000000000000005e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  49.63 
 
 		 437 aa  362  7.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0027  AAA ATPase central domain protein  48.67 
 
 		 459 aa  362  8e-99  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.797145 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1199  AAA ATPase central domain protein  46.34 
 
 		 428 aa  362  9e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  49.14 
 
 		 437 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1824  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 477 aa  361  1e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00142888  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1691  recombination factor protein RarA  47.83 
 
 		 465 aa  360  2e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3882  AAA ATPase central domain-containing protein  48.1 
 
 		 448 aa  360  2e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.781323 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  49.14 
 
 		 437 aa  361  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  46.37 
 
 		 457 aa  360  3e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  46.84 
 
 		 457 aa  359  5e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  46.57 
 
 		 443 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  46.37 
 
 		 457 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0041  recombination factor protein RarA  47.29 
 
 		 459 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.481618  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12760  recombination factor protein RarA  50.59 
 
 		 465 aa  357  2.9999999999999997e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294411  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  49.27 
 
 		 432 aa  357  2.9999999999999997e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1815  recombination factor protein RarA  48.49 
 
 		 502 aa  356  5e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.233507  hitchhiker  0.0000173761 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2364  recombination factor protein RarA  48.29 
 
 		 445 aa  355  5.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602751  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2325  recombination factor protein RarA  48.29 
 
 		 445 aa  356  5.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90539  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  48.29 
 
 		 445 aa  356  5.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12450  Recombination protein MgsA  55.59 
 
 		 499 aa  355  6.999999999999999e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.101973  normal  0.0965428 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2404  recombination factor protein RarA  49.41 
 
 		 456 aa  355  7.999999999999999e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.150461  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2375  recombination factor protein RarA  46.7 
 
 		 463 aa  355  1e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  48.79 
 
 		 449 aa  355  1e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1076  recombination factor protein RarA  47.64 
 
 		 544 aa  355  1e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1498  AAA ATPase central domain protein  44.74 
 
 		 435 aa  354  2e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  47.64 
 
 		 445 aa  354  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1814  AAA ATPase central domain protein  48.89 
 
 		 473 aa  353  2e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2319  AAA ATPase central domain protein  48.69 
 
 		 460 aa  354  2e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  48.51 
 
 		 426 aa  354  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0826  recombination factor protein RarA  46.83 
 
 		 462 aa  353  2.9999999999999997e-96  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1685  AAA ATPase central domain protein  47.79 
 
 		 478 aa  352  5.9999999999999994e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.471753  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  46.38 
 
 		 423 aa  351  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  50.35 
 
 		 429 aa  350  3e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  46.15 
 
 		 425 aa  349  5e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  45.45 
 
 		 426 aa  348  1e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  44.86 
 
 		 463 aa  348  1e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2283  recombination factor protein RarA  49.53 
 
 		 474 aa  348  1e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0243633  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0774  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 444 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0591315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12580  recombination factor protein RarA  49.27 
 
 		 452 aa  347  3e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.214264 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3035  recombination factor protein RarA  48.93 
 
 		 456 aa  346  4e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  46.9 
 
 		 423 aa  345  1e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>