65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2876 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2876  tail assembly protein  100 
 
 
245 aa  511  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156382 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1556  tail assembly protein  96.31 
 
 
245 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.269135  hitchhiker  0.000129562 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1091  tail assembly protein  95.45 
 
 
247 aa  483  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.352892  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2170  tail assembly protein  93.8 
 
 
247 aa  475  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.206428 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2107  NLP/P60 protein  87.92 
 
 
247 aa  455  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000238128  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1470  tail assembly protein  87.08 
 
 
247 aa  448  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0911  tail assembly protein  86.67 
 
 
247 aa  447  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1636  tail assembly protein  86.67 
 
 
247 aa  447  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1201  tail assembly protein  85.42 
 
 
247 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000820398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3123  tail assembly protein  96.67 
 
 
211 aa  427  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0880302 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1875  tail assembly protein  96.19 
 
 
211 aa  425  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.14941 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1198  tail assembly protein  96.21 
 
 
211 aa  427  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2765  tail assembly protein  96.21 
 
 
211 aa  427  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.693268 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3191  tail assembly protein  96.19 
 
 
211 aa  425  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000381124 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1421  tail assembly protein  73.25 
 
 
243 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.964696  normal  0.0356562 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1156  tail assembly protein  73.25 
 
 
245 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00748  hypothetical protein  84.77 
 
 
199 aa  363  1e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10052  tail component  84.77 
 
 
199 aa  363  1e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1084  tail assembly protein  74.5 
 
 
203 aa  321  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.544737 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1060  hypothetical protein  41.35 
 
 
250 aa  158  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.07451  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1692  hypothetical protein  40.34 
 
 
250 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.982855  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2578  NLP/P60 protein  38.67 
 
 
242 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2948  prophage LambdaSo, tail assembly protein K, putative  37.95 
 
 
237 aa  149  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1695  phage HK022 GP19-like protein  40.09 
 
 
236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155814  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08270  hypothetical protein  39.18 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000264439 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3880  NLP/P60 protein  38.66 
 
 
250 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.877885 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0783  hypothetical protein  38.78 
 
 
256 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0035  tail assembly protein  34.38 
 
 
250 aa  144  1e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.360646  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3384  NLP/P60 protein  40.34 
 
 
240 aa  142  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0474396  hitchhiker  0.000000000102411 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3098  NLP/P60 protein  37.78 
 
 
236 aa  131  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19861  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2421  NlpC/P60 family protein  36.59 
 
 
264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2383  NlpC/P60 family protein  37.33 
 
 
236 aa  129  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.886238  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1635  hypothetical protein  36.44 
 
 
246 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537061  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3930  NLP/P60 protein  32.93 
 
 
251 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0445  prophage LambdaSo, tail assembly protein K  37.04 
 
 
249 aa  126  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2222  NLP/P60 protein  36.28 
 
 
236 aa  121  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.878909 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0051  NlpC/P60 domain-containing protein  45.38 
 
 
169 aa  114  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.990014  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2777  NLP/P60  31.5 
 
 
254 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0126559 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7022  NLP/P60 protein  35.51 
 
 
275 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6224  NLP/P60 protein  36.4 
 
 
275 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5752  NLP/P60 protein  35.25 
 
 
272 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4059  NLP/P60 protein  35.25 
 
 
272 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0092  NlpC/P60 family protein  31.17 
 
 
252 aa  86.7  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3880  NLP/P60 protein  35.59 
 
 
272 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5049  NLP/P60 protein  34.43 
 
 
272 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3529  NLP/P60 protein  34.43 
 
 
272 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3497  NLP/P60 protein  26.79 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2943  hypothetical protein  41.77 
 
 
85 aa  64.3  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0313  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.54 
 
 
137 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4108  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.57 
 
 
138 aa  47  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2540  Mov34/MPN/PAD-1  31.43 
 
 
139 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000146733  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1532  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  38.82 
 
 
164 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.909017  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1310  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.98 
 
 
152 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3493  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  37.08 
 
 
145 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1356  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.67 
 
 
157 aa  43.5  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5654  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.72 
 
 
148 aa  42.7  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2370  Mov34/MPN/PAD-1  33.65 
 
 
135 aa  42.7  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0866  Mov34/MPN/PAD-1  30.63 
 
 
134 aa  42.4  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29180  predicted metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily  29.37 
 
 
152 aa  42.7  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.940128  normal  0.744065 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3170  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  30.88 
 
 
146 aa  42.4  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.402243  normal  0.0218812 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2352  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.33 
 
 
137 aa  42.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.3009  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  27.84 
 
 
476 aa  42  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  28.75 
 
 
278 aa  42  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0936  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.09 
 
 
137 aa  42  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.73483 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0381  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.75 
 
 
144 aa  42  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0397123  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>