More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00462 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  98.9 
 
 		 453 aa  932    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  100 
 
 		 453 aa  939    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  93.6 
 
 		 453 aa  893    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  99.56 
 
 		 453 aa  936    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  93.6 
 
 		 453 aa  893    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  99.12 
 
 		 453 aa  934    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  99.12 
 
 		 453 aa  934    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  93.6 
 
 		 453 aa  893    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  100 
 
 		 453 aa  939    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  93.6 
 
 		 453 aa  893    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  99.34 
 
 		 453 aa  932    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0775  allantoinase  50.66 
 
 		 458 aa  470  1.0000000000000001e-131  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.257845 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.62 
 
 		 454 aa  389  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  42.7 
 
 		 449 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  41.15 
 
 		 448 aa  350  2e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  40.62 
 
 		 449 aa  347  3e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  40 
 
 		 461 aa  345  7e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2550  allantoinase  39.09 
 
 		 435 aa  308  9e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0293487  normal  0.265015 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0714  allantoinase  38.13 
 
 		 449 aa  296  6e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.866042  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2590  allantoinase  39.12 
 
 		 476 aa  293  3e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.247318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4856  allantoinase  35.62 
 
 		 446 aa  292  8e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6769  allantoinase  34.73 
 
 		 448 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4726  allantoinase  35.83 
 
 		 443 aa  286  5e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2841  allantoinase  37.64 
 
 		 450 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2784  allantoinase  37.59 
 
 		 468 aa  280  5e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3169  allantoinase  36.16 
 
 		 455 aa  278  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45812  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2026  allantoinase  35.25 
 
 		 449 aa  277  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2778  allantoinase  36.84 
 
 		 457 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  35.93 
 
 		 452 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3440  allantoinase  35.09 
 
 		 447 aa  265  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.43 
 
 		 494 aa  264  3e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.57 
 
 		 457 aa  263  4.999999999999999e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4867  putative allantoinase  36.75 
 
 		 473 aa  259  7e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0235  allantoinase  35.76 
 
 		 442 aa  258  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3693  allantoinase  34.55 
 
 		 447 aa  256  7e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2077  Allantoinase  38.8 
 
 		 473 aa  255  9e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5937  allantoinase  38.4 
 
 		 569 aa  253  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04603  allantoinase (Eurofung)  33.54 
 
 		 506 aa  247  3e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0105503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08130  allantoinase  33.72 
 
 		 503 aa  247  3e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5681  allantoinase  32.82 
 
 		 480 aa  240  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0839  allantoinase  35.96 
 
 		 453 aa  239  8e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3269  amidohydrolase  32.09 
 
 		 470 aa  219  1e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  32.39 
 
 		 477 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5170  dihydropyrimidinase  32.84 
 
 		 469 aa  213  7e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00740  allantoinase, putative  31.09 
 
 		 481 aa  212  9e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260502  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3987  amidohydrolase  31.77 
 
 		 460 aa  210  4e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  31.36 
 
 		 454 aa  210  4e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  32.49 
 
 		 456 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  32.49 
 
 		 456 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  32.68 
 
 		 446 aa  207  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  29.72 
 
 		 453 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2214  phenylhydantoinase  31.88 
 
 		 472 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  31.82 
 
 		 467 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  31.14 
 
 		 468 aa  204  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  32.57 
 
 		 442 aa  204  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  31.88 
 
 		 445 aa  204  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  31.41 
 
 		 432 aa  203  4e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  32.82 
 
 		 453 aa  202  8e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3445  dihydropyrimidinase  31.76 
 
 		 460 aa  202  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00364742  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  32.95 
 
 		 464 aa  201  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0686  dihydropyrimidinase  30.49 
 
 		 469 aa  200  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000587372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  32.03 
 
 		 456 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5703  amidohydrolase  33.41 
 
 		 454 aa  199  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0693398  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  31.5 
 
 		 465 aa  199  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  32.65 
 
 		 444 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0931  dihydropyrimidinase  31.28 
 
 		 464 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.303478 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  31.88 
 
 		 444 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  30.94 
 
 		 444 aa  197  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  32.64 
 
 		 441 aa  196  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4616  phenylhydantoinase  33.11 
 
 		 466 aa  196  6e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  30.72 
 
 		 444 aa  196  8.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  32.05 
 
 		 444 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  30.79 
 
 		 444 aa  194  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5687  dihydropyrimidinase  31.21 
 
 		 477 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  normal  0.131902 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4277  phenylhydantoinase  30.04 
 
 		 475 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  30.24 
 
 		 442 aa  194  4e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  32.05 
 
 		 446 aa  193  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  32.85 
 
 		 458 aa  193  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  33.41 
 
 		 444 aa  193  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0551  phenylhydantoinase  31.62 
 
 		 478 aa  192  9e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6385  D-hydantoinase  30.13 
 
 		 475 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6618  dihydropyrimidinase  30.13 
 
 		 475 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6216  dihydropyrimidinase  30.13 
 
 		 475 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1430  dihydropyrimidinase  29.25 
 
 		 456 aa  191  2e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  33.04 
 
 		 439 aa  191  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  30.28 
 
 		 471 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  31.82 
 
 		 446 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  30.93 
 
 		 472 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  29.57 
 
 		 474 aa  190  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  30.22 
 
 		 445 aa  190  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  30.28 
 
 		 446 aa  189  7e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5682  amidohydrolase  31.21 
 
 		 444 aa  189  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.74183  normal  0.205255 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  30.8 
 
 		 488 aa  189  1e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  30.53 
 
 		 440 aa  189  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0357  dihydropyrimidinase  29.68 
 
 		 457 aa  188  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.990091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  29.45 
 
 		 422 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1496  phenylhydantoinase  28.6 
 
 		 457 aa  188  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  31.49 
 
 		 444 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  31.72 
 
 		 475 aa  187  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_004310  BR0278  phenylhydantoinase  31.58 
 
 		 489 aa  186  6e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>