More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1379 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1379  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 481 aa  955    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.892961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0393  cation diffusion facilitator family transporter  60 
 
 		 483 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.38697 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2245  cation diffusion facilitator family transporter  43.35 
 
 		 483 aa  343  2.9999999999999997e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1202  cation diffusion facilitator family transporter  45.68 
 
 		 488 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0622136  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  39.67 
 
 		 476 aa  313  2.9999999999999996e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  34.74 
 
 		 460 aa  294  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0974  cation diffusion facilitator family transporter  36.92 
 
 		 466 aa  292  1e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  34.29 
 
 		 459 aa  274  3e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0550  cation efflux protein  33.48 
 
 		 459 aa  259  6e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.247369 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  35.12 
 
 		 460 aa  254  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0198  cation diffusion facilitator family transporter  33.48 
 
 		 474 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.859565 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1450  cation diffusion facilitator family transporter  36.85 
 
 		 460 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25137  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0853  cation diffusion facilitator family transporter  33.55 
 
 		 479 aa  231  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3435  cation diffusion facilitator family transporter  34.69 
 
 		 478 aa  226  9e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0253813 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2019  cation diffusion facilitator family transporter  35.12 
 
 		 459 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1201  cation efflux protein  37.19 
 
 		 460 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2149  cation diffusion facilitator family transporter  35.65 
 
 		 460 aa  222  9e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3095  putative cation-efflux pump  36.18 
 
 		 462 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1848  cation diffusion facilitator family transporter  34.48 
 
 		 460 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.762115 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  39.39 
 
 		 308 aa  186  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  35.88 
 
 		 311 aa  183  6e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  35.22 
 
 		 311 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  37.25 
 
 		 307 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1684  cation diffusion facilitator family transporter  29.98 
 
 		 450 aa  173  5e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000631579  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  36.21 
 
 		 311 aa  172  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  36.36 
 
 		 323 aa  172  9e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  36.09 
 
 		 328 aa  170  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  37.71 
 
 		 307 aa  169  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  34.25 
 
 		 285 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  36.95 
 
 		 300 aa  160  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  36.88 
 
 		 310 aa  157  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  33.56 
 
 		 309 aa  156  9e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  37.85 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  34.74 
 
 		 312 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  34.12 
 
 		 307 aa  151  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  34.58 
 
 		 315 aa  152  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0332  cation diffusion facilitator family transporter  25.06 
 
 		 450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  33.9 
 
 		 314 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  34.25 
 
 		 313 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  31.37 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  34.45 
 
 		 327 aa  144  4e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0125  cation diffusion facilitator family transporter  31.21 
 
 		 317 aa  143  7e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  36.01 
 
 		 308 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2239  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 305 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.482091  normal  0.467458 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  36.01 
 
 		 308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  35.66 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  27.88 
 
 		 299 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  35.89 
 
 		 315 aa  137  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  33.56 
 
 		 305 aa  136  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1215  cation diffusion facilitator family transporter  35.49 
 
 		 302 aa  134  3e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  31.05 
 
 		 304 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  28.76 
 
 		 301 aa  133  7.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1891  cation diffusion facilitator family transporter  34.01 
 
 		 314 aa  132  9e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0381749 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  34.86 
 
 		 315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  30.2 
 
 		 300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  32.69 
 
 		 320 aa  131  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  33.89 
 
 		 305 aa  131  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4753  cation diffusion facilitator family transporter  31.6 
 
 		 296 aa  130  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36054  decreased coverage  0.00983844 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  32.73 
 
 		 300 aa  129  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  31.72 
 
 		 306 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  29.53 
 
 		 302 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.87 
 
 		 302 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  31.05 
 
 		 304 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2873  cation diffusion facilitator family transporter  37.63 
 
 		 314 aa  127  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  32.12 
 
 		 305 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  29.15 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0241  cation diffusion facilitator family transporter  31.19 
 
 		 310 aa  126  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000961232  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  29.51 
 
 		 312 aa  126  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1360  cation diffusion facilitator family transporter  29.62 
 
 		 396 aa  124  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  30.41 
 
 		 317 aa  124  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  30.95 
 
 		 300 aa  124  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  32.56 
 
 		 293 aa  124  4e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  29.64 
 
 		 300 aa  124  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0116  cation diffusion facilitator family transporter  29.58 
 
 		 323 aa  123  8e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.358203  normal  0.378394 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  31.33 
 
 		 297 aa  123  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  29.64 
 
 		 300 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  29.64 
 
 		 300 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  32.78 
 
 		 312 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  30.39 
 
 		 304 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  29.64 
 
 		 300 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  26.9 
 
 		 302 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  29.64 
 
 		 300 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  28.99 
 
 		 300 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  29.64 
 
 		 300 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  29.64 
 
 		 300 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  29.64 
 
 		 300 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  31.12 
 
 		 300 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  29.64 
 
 		 300 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  31.12 
 
 		 300 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  33.56 
 
 		 295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  31.93 
 
 		 302 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  34.06 
 
 		 285 aa  121  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  27.9 
 
 		 300 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4947  cation diffusion facilitator family transporter  30.87 
 
 		 312 aa  121  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  27.8 
 
 		 300 aa  121  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  27.9 
 
 		 300 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  28.76 
 
 		 297 aa  121  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  27.9 
 
 		 300 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  30.77 
 
 		 300 aa  120  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  30.67 
 
 		 297 aa  120  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>