More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2398 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2398  ABC transporter related  100 
 
 		 310 aa  617  1e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2273  nickel transporter ATP-binding protein NikE  47.69 
 
 		 277 aa  225  9e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215023  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0347  ABC transporter related  42.11 
 
 		 320 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5440  ABC transporter related  45.65 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0817  ABC transporter related  44.92 
 
 		 285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0888  ABC transporter related  42.86 
 
 		 285 aa  198  9e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3841  nickel transporter ATP-binding protein NikE  39.71 
 
 		 268 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0235  nickel import ATP-binding protein NikE  43.35 
 
 		 268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0800  nickel transporter ATP-binding protein NikE  45.61 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306666  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4820  nickel transporter ATP-binding protein NikE  40.07 
 
 		 268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0750  nickel transporter ATP-binding protein NikE  45.61 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03329  nickel transporter subunit  44.3 
 
 		 268 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3679  nickel transporter ATP-binding protein NikE  40.07 
 
 		 268 aa  196  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03282  hypothetical protein  44.3 
 
 		 268 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0236  nickel transporter ATP-binding protein NikE  44.3 
 
 		 268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3964  nickel transporter ATP-binding protein NikE  44.3 
 
 		 268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3764  nickel transporter ATP-binding protein NikE  39.71 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7618  nickel transporter ATP-binding protein NikE  44.74 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1029  ABC transporter related  47.6 
 
 		 544 aa  187  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1838  nickel transporter ATP-binding protein NikE  46.23 
 
 		 268 aa  186  5e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.365514  hitchhiker  0.00699569 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0472  ABC transporter related  42.11 
 
 		 545 aa  185  7e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197295  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6072  ABC transporter related  43.93 
 
 		 263 aa  183  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0024  ABC transporter related protein  41.2 
 
 		 254 aa  183  3e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000767046  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1310  ABC transporter related  43.04 
 
 		 544 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0559382  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3738  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.67 
 
 		 680 aa  182  7e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.31873  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3617  ABC transporter-related protein  45.04 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.606564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4353  ABC transporter related  42.42 
 
 		 276 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.762556  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1777  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.74 
 
 		 326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000396246 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3632  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.26 
 
 		 691 aa  179  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.208084  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2440  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.87 
 
 		 326 aa  178  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4781  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.18 
 
 		 703 aa  176  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1324  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine methyltransferase  37.75 
 
 		 517 aa  176  4e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000609088  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0102  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.62 
 
 		 352 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1802  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.38 
 
 		 307 aa  176  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0111168  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3988  ABC transporter related  42.19 
 
 		 547 aa  176  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0956  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.95 
 
 		 339 aa  176  6e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.960319  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  40.65 
 
 		 534 aa  175  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6473  putative oligopeptide ABC transporter (ATP binding protein)  40.43 
 
 		 350 aa  175  9e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  41.88 
 
 		 539 aa  175  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0847  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  38.91 
 
 		 325 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  38.43 
 
 		 627 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0126  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.64 
 
 		 347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  42.17 
 
 		 549 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01760  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  42.92 
 
 		 584 aa  173  2.9999999999999996e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  40.94 
 
 		 539 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1823  ABC transporter related  42.36 
 
 		 545 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0401601  normal  0.812901 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0128  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  40.23 
 
 		 346 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6179  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.08 
 
 		 299 aa  172  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.61654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  41.41 
 
 		 541 aa  172  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  40.78 
 
 		 541 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05960  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  40.66 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3476  ABC transporter related  46.64 
 
 		 594 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0289183  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  40 
 
 		 546 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4045  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.9 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1083  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.8 
 
 		 388 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5661  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.81 
 
 		 553 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.755522  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4339  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.92 
 
 		 708 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108178  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3346  nickel transporter ATP-binding protein NikE  44.83 
 
 		 273 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  37.88 
 
 		 538 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  41.13 
 
 		 540 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3071  ABC transporter related  39.83 
 
 		 613 aa  170  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580888 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  44.44 
 
 		 370 aa  169  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  39.3 
 
 		 592 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2624  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.22 
 
 		 331 aa  169  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.591413  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0615  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.24 
 
 		 327 aa  169  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6087  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.13 
 
 		 614 aa  169  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725857 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  39.65 
 
 		 592 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0950  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  39.74 
 
 		 276 aa  169  6e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2126  ABC transporter related  39.61 
 
 		 556 aa  169  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  39.65 
 
 		 592 aa  169  6e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3778  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  42.8 
 
 		 328 aa  169  6e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1929  ABC transporter related  39.3 
 
 		 271 aa  169  6e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2828  ABC transporter related  38.6 
 
 		 613 aa  169  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.966478  normal  0.396925 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3882  ABC di/oligopeptide transporter, ATPase subunit  40.52 
 
 		 342 aa  169  6e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0441642  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  41.25 
 
 		 539 aa  169  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  40.32 
 
 		 550 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2704  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.46 
 
 		 347 aa  169  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.298675 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3268  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.12 
 
 		 342 aa  168  9e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5508  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  37.17 
 
 		 355 aa  168  9e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467167  normal  0.444532 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7226  ABC transporter related  41.28 
 
 		 624 aa  168  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0885974  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1292  ABC transporter related  38.96 
 
 		 282 aa  168  9e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0488564  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3307  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  38.7 
 
 		 349 aa  168  9e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.595916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  40.68 
 
 		 585 aa  168  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1008  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  39.74 
 
 		 282 aa  168  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0154  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  39.84 
 
 		 613 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4657  ABC transporter related  39.07 
 
 		 605 aa  168  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168066  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0389  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.63 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0879  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.84 
 
 		 436 aa  168  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3009  nickel transporter ATP-binding protein NikE  41.18 
 
 		 273 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.208054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2314  ABC transporter related  42.8 
 
 		 536 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.399989  normal  0.717185 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5293  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.32 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2416  ABC transporter related  39.64 
 
 		 505 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48904  normal  0.517623 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  40.24 
 
 		 619 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0876  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  39.69 
 
 		 345 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5512  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  38.08 
 
 		 366 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.312894 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  39.11 
 
 		 557 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  40.91 
 
 		 540 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4158  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.52 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.47241 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3819  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.13 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.940493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0452  ABC transporter related  42.29 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>