203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1995 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1995  Malate/L-lactate dehydrogenase  100 
 
 
356 aa  697    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5976  malate/L-lactate dehydrogenase  56.72 
 
 
329 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3707  Malate/L-lactate dehydrogenase  54.83 
 
 
329 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717788  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3531  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  47.34 
 
 
338 aa  272  7e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2039  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  47.8 
 
 
339 aa  271  9e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308465  normal  0.10893 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1771  malate dehydrogenase (NADP+)  45.32 
 
 
333 aa  259  4e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3386  malate/L-lactate dehydrogenase  43.28 
 
 
344 aa  238  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188787  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3821  Malate/L-lactate dehydrogenase  45.7 
 
 
333 aa  219  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2181  malate/L-lactate dehydrogenase  41.57 
 
 
341 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730994  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  41.57 
 
 
332 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.127948  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0890  malate dehydrogenase (NADP(+))  42.64 
 
 
337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.416405  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2325  malate/L-lactate dehydrogenase  41.06 
 
 
341 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2481  Malate/L-lactate dehydrogenase  41.21 
 
 
350 aa  211  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.295713  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3134  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  41.6 
 
 
350 aa  211  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2567  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  39.88 
 
 
343 aa  202  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2806  malate/L-lactate dehydrogenase  41.46 
 
 
341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1965  Malate/L-lactate dehydrogenase  35.01 
 
 
349 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5908  malate/L-lactate dehydrogenase  36.96 
 
 
348 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767932  normal  0.259263 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2143  malate/L-lactate dehydrogenase  40.73 
 
 
343 aa  193  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2359  ureidoglycolate dehydrogenase  40.67 
 
 
343 aa  192  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0799414  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48020  putative L-malate dehydrogenase  38.82 
 
 
334 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00543766  normal  0.806598 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2071  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  37.57 
 
 
344 aa  187  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4866  malate/L-lactate dehydrogenase  37.17 
 
 
343 aa  186  7e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.871504 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0467  malate/L-lactate dehydrogenase  37.28 
 
 
344 aa  186  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0193555  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0565  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  37.28 
 
 
344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4140  putative L-malate dehydrogenase  39.71 
 
 
334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1423  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  36.99 
 
 
344 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2191  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  36.99 
 
 
344 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7734  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0876  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  36.99 
 
 
344 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5095  malate/L-sulfolactate dehydrogenase  34.87 
 
 
336 aa  182  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.394875  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1882  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  37.64 
 
 
346 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2899  malate/L-lactate dehydrogenase  36.42 
 
 
343 aa  180  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4230  malate/L-lactate dehydrogenase  35.84 
 
 
340 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867251  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4136  malate/L-lactate dehydrogenase  35.84 
 
 
340 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00167643  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0240  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  37.01 
 
 
345 aa  179  9e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1898  malate/L-lactate dehydrogenase  35.55 
 
 
340 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3547  malate/L-lactate dehydrogenase  34.97 
 
 
340 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312581  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2460  Malate/L-lactate dehydrogenase  39.16 
 
 
332 aa  176  5e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.462463  normal  0.424156 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0941  malate/L-lactate dehydrogenase  38.79 
 
 
344 aa  176  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3383  malate/L-lactate dehydrogenase  35.55 
 
 
340 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.245063 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6385  Malate/L-lactate dehydrogenase  35.15 
 
 
344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.738936 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4451  malate/L-lactate dehydrogenase  35.26 
 
 
340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.932071  normal  0.983575 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4028  malate/L-lactate dehydrogenase  34.68 
 
 
340 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0113292  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4412  Malate dehydrogenase  31.74 
 
 
351 aa  173  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3870  malate/L-lactate dehydrogenase  36.53 
 
 
345 aa  172  7.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4855  malate/L-lactate dehydrogenase  33.33 
 
 
356 aa  169  5e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.245039  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1014  Malate/L-lactate dehydrogenase  38.44 
 
 
331 aa  169  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.928457  normal  0.525651 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0724  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  37.5 
 
 
353 aa  169  9e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2116  malate/L-lactate dehydrogenase  33.14 
 
 
339 aa  169  9e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1835  malate/L-lactate dehydrogenase  33.94 
 
 
337 aa  169  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.722064  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2563  Malate dehydrogenase  33.74 
 
 
336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0709444  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07633  malate/L-lactate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13810)  31.1 
 
 
361 aa  162  8.000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.571482 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0219  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  35.52 
 
 
319 aa  161  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5101  malate/L-lactate dehydrogenase  40.82 
 
 
331 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.540647 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7014  malate dehydrogenase  34.08 
 
 
349 aa  162  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3323  malate/L-lactate dehydrogenase  32.65 
 
 
348 aa  160  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.115763 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5300  malate/L-lactate dehydrogenase  35.29 
 
 
352 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0455  malate/L-lactate dehydrogenase  32.65 
 
 
345 aa  154  2e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3243  ureidoglycolate dehydrogenase  28.49 
 
 
335 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3327  ureidoglycolate dehydrogenase  28.49 
 
 
335 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.388816 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0451  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  29.05 
 
 
347 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3319  ureidoglycolate dehydrogenase  28.49 
 
 
335 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.910608 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2141  malate/L-lactate dehydrogenase  36.55 
 
 
328 aa  153  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437506  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1534  malate/L-lactate dehydrogenase  28.77 
 
 
347 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.975187  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3719  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  33.44 
 
 
349 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4649  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  33.44 
 
 
349 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3620  Malate/L-lactate dehydrogenase  36.16 
 
 
353 aa  151  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0385  malate/L-lactate dehydrogenase  28.77 
 
 
347 aa  151  1e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.214984 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5261  malate/L-lactate dehydrogenase  32.47 
 
 
334 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0410  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.66 
 
 
383 aa  149  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5655  malate/L-lactate dehydrogenase  33.12 
 
 
349 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.64858 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6359  malate/L-lactate dehydrogenase  32.35 
 
 
349 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.137633  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4453  malate/L-lactate dehydrogenase  33.23 
 
 
337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3789  Malate/L-lactate dehydrogenase  37.63 
 
 
732 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1015  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  29.28 
 
 
345 aa  142  9e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.759663  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4818  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.62 
 
 
334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.949996  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3898  Malate/L-lactate dehydrogenase  35.6 
 
 
360 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1791  Malate/L-lactate dehydrogenase  26.72 
 
 
334 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3020  malate/L-lactate dehydrogenase  35.89 
 
 
348 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0581  ureidoglycolate dehydrogenase  29.11 
 
 
349 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.131047 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0574  ureidoglycolate dehydrogenase  29.11 
 
 
349 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00467  ureidoglycolate dehydrogenase  30.31 
 
 
349 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0576  ureidoglycolate dehydrogenase  29.11 
 
 
349 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00472  hypothetical protein  30.31 
 
 
349 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2541  malate/L-lactate dehydrogenase  31.9 
 
 
349 aa  138  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2546  dehydrogenase  31.46 
 
 
351 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.637789  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3105  ureidoglycolate dehydrogenase  30.03 
 
 
349 aa  138  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0635  ureidoglycolate dehydrogenase  29.07 
 
 
349 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0591  ureidoglycolate dehydrogenase  30.03 
 
 
349 aa  138  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.560596  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0555  ureidoglycolate dehydrogenase  30.31 
 
 
349 aa  138  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0562  ureidoglycolate dehydrogenase  29.75 
 
 
349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  33.53 
 
 
351 aa  137  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.521695  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0618  ureidoglycolate dehydrogenase  29.75 
 
 
349 aa  136  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3096  ureidoglycolate dehydrogenase  29.46 
 
 
349 aa  135  8e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4997  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  36.33 
 
 
344 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1122  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  28.06 
 
 
328 aa  135  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.658322  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5277  hypothetical protein  32.17 
 
 
368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0968359  normal  0.077183 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5456  hypothetical protein  34.1 
 
 
367 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4858  Malate/L-lactate dehydrogenase  36.51 
 
 
333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.169234 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3304  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  31.42 
 
 
336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0489391 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>