172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1903 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1903  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 		 213 aa  436  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2645  hydrolase  76.78 
 
 		 213 aa  345  3e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2045  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  58.57 
 
 		 217 aa  261  8e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3690  HAD superfamily hydrolase  52.66 
 
 		 216 aa  227  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0426  haloacid dehalogenase-like hydrolase  36.18 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1591  HAD family hydrolase  33.18 
 
 		 229 aa  131  6.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0288  HAD family hydrolase  33.84 
 
 		 225 aa  121  8e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0966824  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1599  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.18 
 
 		 211 aa  118  7e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0287607  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1789  HAD superfamily hydrolase  34.88 
 
 		 227 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0065723 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0761  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.78 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0134246 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2667  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.43 
 
 		 223 aa  85.1  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1530  hydrolase  26.13 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.49295 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3254  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.91 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1871  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.94 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0956  putative phosphatase  26.92 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0174  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000420461  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0356  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1348  HAD family hydrolase  29.71 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.523514  hitchhiker  0.0000000193697 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2784  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.61 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14011  hypothetical protein  20.11 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.34 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00317051 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2768  HAD family hydrolase  26.5 
 
 		 237 aa  52.8  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  0.45248 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  28.33 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.58 
 
 		 224 aa  52  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0108500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  24.18 
 
 		 223 aa  52  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.51 
 
 		 221 aa  52  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3972  HAD family hydrolase  28.25 
 
 		 241 aa  50.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0786  HAD-superfamily hydrolase  25.54 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  25.41 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  25.39 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0280  HAD family hydrolase  26.15 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.15 
 
 		 233 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0341719 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  25.38 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2451  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.27 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3129  fructose-1-phosphatase  25.41 
 
 		 188 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000901286  normal  0.0148605 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0484  HAD family sugar phosphatase  22.97 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0956  phosphatase, putative  23.81 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000103613  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3005  fructose-1-phosphatase  25.41 
 
 		 188 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  hitchhiker  0.0000277628 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  24.31 
 
 		 396 aa  50.1  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3367  isochorismate synthase  29.32 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0514575 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4216  6-phosphogluconate phosphatase  23.72 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0794  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.78 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0913327  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  25.71 
 
 		 228 aa  48.9  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2970  fructose-1-phosphatase  25.41 
 
 		 269 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00804181  decreased coverage  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2682  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.26 
 
 		 226 aa  48.9  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  26.11 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  26.11 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12851  phosphatase  23.84 
 
 		 216 aa  48.5  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.35108  normal  0.0690398 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  26.11 
 
 		 202 aa  48.5  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  24.32 
 
 		 188 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1018  HAD family hydrolase  23.19 
 
 		 221 aa  48.1  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4839  AHBA synthesis associated protein  28.8 
 
 		 237 aa  48.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2616  HAD family hydrolase  28.86 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  25.38 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  24.59 
 
 		 263 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2640  HAD family hydrolase  28.36 
 
 		 237 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576989  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4007  6-phosphogluconate phosphatase  23.88 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  24.32 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0959  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  28.87 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0734377  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  24.32 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2643  HAD family hydrolase  26.17 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735097  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  24.32 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  28.95 
 
 		 233 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1982  HAD family hydrolase  28.36 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.118092  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2592  HAD family hydrolase  28.36 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119238  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1715  HAD family hydrolase  27.22 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.101498 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  25.27 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  22.65 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  24.32 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  24.32 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  24.32 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0020  6-phosphogluconate phosphatase  25.96 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.334296 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4356  HAD family hydrolase  28.81 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.582602 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  23.04 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  22.65 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  22.65 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  24.32 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7580  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.31 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0100  HAD family hydrolase  20.18 
 
 		 468 aa  46.2  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0368988  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2939  fructose-1-phosphatase  24.86 
 
 		 188 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320797  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0937  HAD family hydrolase  26.56 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0791  HAD family hydrolase  33.65 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0436  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  29.2 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4274  6-phosphogluconate phosphatase  24.07 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0422  hydrolase  23.9 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  25.13 
 
 		 272 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1562  putative hydrolase  25.11 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.320439  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2242  phosphatases  26.63 
 
 		 256 aa  46.2  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5021  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.5 
 
 		 223 aa  46.2  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886555  normal  0.11436 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1460  HAD family hydrolase  25.41 
 
 		 229 aa  46.2  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00552213  normal  0.266811 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3082  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.17 
 
 		 224 aa  46.2  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48861  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1257  AHBA synthesis associated protein  25.13 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136935  hitchhiker  0.0000231922 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0085  HAD family hydrolase  26.32 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  24.55 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2508  HAD family hydrolase  29.06 
 
 		 237 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.076946  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1438  hypothetical protein  25.56 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  0.0550333 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2888  HAD family hydrolase  21.43 
 
 		 215 aa  45.4  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00226  hypothetical phosphatase/phosphohexomutase  27.07 
 
 		 194 aa  45.4  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2348  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  23.56 
 
 		 342 aa  45.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000426871  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  24.58 
 
 		 238 aa  45.4  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>