56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1643 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1643  phage tape measure protein  100 
 
 		 938 aa  1872    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2689  hypothetical protein  44.74 
 
 		 1056 aa  125  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5328  phage tape measure protein  29.52 
 
 		 837 aa  122  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.227887  normal  0.0605848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3289  phage tape measure protein  41.8 
 
 		 838 aa  121  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.4409 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2173  tail length tape measure protein  27.34 
 
 		 1080 aa  97.1  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0499654 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1549  tail length tape measure protein  27.34 
 
 		 1080 aa  97.1  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0203252  hitchhiker  0.00310541 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2883  tail length tape measure protein  28.1 
 
 		 1080 aa  96.7  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541295 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2237  tail length tape measure protein  28.35 
 
 		 1080 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550584 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1198  lambda family phage tail tape measure protein  36.24 
 
 		 1075 aa  91.7  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101212 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3444  phage tape measure protein  36.59 
 
 		 904 aa  88.2  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0703  gifsy-1 prophage VmtH  31.87 
 
 		 1031 aa  85.9  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431467 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2801  gifsy-1 prophage VmtH  31.87 
 
 		 1031 aa  85.9  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.617877 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1079  gifsy-1 prophage VmtH  32.79 
 
 		 1028 aa  84  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.497302  normal  0.0993737 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1416  gifsy-1 prophage VmtH  29.51 
 
 		 1028 aa  83.2  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.312107  hitchhiker  0.00396593 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2417  phage tail tape measure protein lambda  29.63 
 
 		 1063 aa  82  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.570693  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1331  hypothetical protein  27.5 
 
 		 1655 aa  80.9  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0908  putative prophage tail length tape measure protein  29.51 
 
 		 1021 aa  79  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4084  lambda family phage tail tape measure protein  28.02 
 
 		 1251 aa  75.9  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.622569  normal  0.0282318 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1404  hypothetical protein  26.9 
 
 		 710 aa  74.7  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2780  Phage tail tape measure protein lambda  24.21 
 
 		 1161 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0242921 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2225  lambda family phage tail tape measure protein  50.79 
 
 		 1095 aa  70.9  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1076  tail tape meausure protein, putative  26.54 
 
 		 974 aa  68.6  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0915  phage-related minor tail protein-like protein  49.37 
 
 		 205 aa  65.5  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962484 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2167  hypothetical protein  32.68 
 
 		 222 aa  64.3  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4975  gene transfer agent (GTA) orfg11  41.58 
 
 		 192 aa  63.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  hitchhiker  0.000111577 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1068  phage-related minor tail protein-like  43.48 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.136113 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0765  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.83 
 
 		 1306 aa  60.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0789  phage tape measure protein  26.15 
 
 		 1306 aa  56.6  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.204936 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2891  phage-related minor tail protein-like  53.45 
 
 		 223 aa  55.8  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.402699  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2475  putative phage tail minor protein  44.19 
 
 		 206 aa  54.7  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0334459  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22120  hypothetical protein  31.36 
 
 		 774 aa  54.3  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000849243  unclonable  1.93803e-21 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1642  Phage-related minor tail protein-like  63.41 
 
 		 222 aa  54.3  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_004310  BR0597  hypothetical protein  45.59 
 
 		 181 aa  52  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0597  hypothetical protein  45.59 
 
 		 189 aa  52  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3933  lambda family phage tail tape measure protein  51.16 
 
 		 1104 aa  51.2  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1140  putative phage tail minor protein  43.02 
 
 		 216 aa  51.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.594391 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1085  hypothetical protein  40.7 
 
 		 217 aa  51.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0521861 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3462  gene transfer agent (GTA) orfg11  40.4 
 
 		 196 aa  50.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.251991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3164  gene transfer agent (GTA) orfg11  50 
 
 		 190 aa  50.8  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0939369  normal  0.0138275 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2112  gene transfer agent (GTA) like protein  41.18 
 
 		 197 aa  50.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631991  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0089  putative phage tail tape measure protein  28.4 
 
 		 1521 aa  50.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1349  hypothetical protein  50.85 
 
 		 199 aa  49.7  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.0000819599  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08240  hypothetical protein  42.67 
 
 		 611 aa  49.3  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000139555 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1684  phage tape measure protein  23.63 
 
 		 1292 aa  48.5  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1986  gene transfer agent (GTA) orfg11  44.93 
 
 		 188 aa  48.9  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.526673 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1418  gene transfer agent (GTA) orfg11  60 
 
 		 208 aa  48.9  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303639  normal  0.105083 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1820  gene transfer agent (GTA) like protein  56.82 
 
 		 195 aa  48.5  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299627  normal  0.353645 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0780  hypothetical protein  43.48 
 
 		 612 aa  48.1  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612791  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2235  prophage tail length tape measure  53.49 
 
 		 1113 aa  46.6  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1177  gene transfer agent (GTA) like protein  54.55 
 
 		 194 aa  46.6  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  23.08 
 
 		 908 aa  45.8  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4676  hypothetical protein  38.67 
 
 		 1609 aa  45.8  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1696  gene transfer agent (GTA) orfg11  57.78 
 
 		 208 aa  45.1  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal  0.463423 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1422  gene transfer agent (GTA) orfg11  57.78 
 
 		 208 aa  45.1  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0992875  normal  0.120159 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2103  phage tape measure protein  28.08 
 
 		 1307 aa  45.1  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.56214  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3355  putative tape measure protein  28.83 
 
 		 775 aa  44.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>