170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1621 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1621  flagellar hook-associated protein 2 domain protein  100 
 
 
579 aa  1149    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1120  flagellar hook-associated protein 2, putative  37.31 
 
 
575 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.176879  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2119  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  35.6 
 
 
575 aa  335  2e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2912  flagellar hook-associated 2 domain protein  34.76 
 
 
577 aa  301  2e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.139401 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2386  flagellar hook-associated 2 domain protein  37.19 
 
 
686 aa  232  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0530  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.23 
 
 
1025 aa  163  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0084  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.49 
 
 
479 aa  108  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  27.46 
 
 
487 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.15 
 
 
447 aa  94.7  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  28.88 
 
 
465 aa  93.6  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.03 
 
 
477 aa  91.7  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  28.4 
 
 
468 aa  90.9  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.4 
 
 
468 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1291  hypothetical protein  23.54 
 
 
541 aa  89.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1147  flagellar hook-associated 2 domain protein  35.71 
 
 
554 aa  89.4  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1257  flagellar capping protein  28.16 
 
 
468 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.218616 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1715  flagellar capping protein  28.16 
 
 
468 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.207421 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2159  flagellar capping protein  28.16 
 
 
468 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.39 
 
 
454 aa  88.2  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01000  flagellar protein  29.35 
 
 
441 aa  87.8  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0813723  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06166  flagellar protein  29.35 
 
 
441 aa  87.8  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332018  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.82 
 
 
454 aa  87  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1339  flagellar hook-associated 2-like  28.35 
 
 
669 aa  87  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.542838  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.82 
 
 
454 aa  87  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3201  flagellar capping protein  28.57 
 
 
500 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1292  hypothetical protein  23.37 
 
 
541 aa  85.9  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  26.48 
 
 
469 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  25.71 
 
 
466 aa  83.2  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  25.77 
 
 
668 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3638  flagellar hook-associated 2-like protein  29.15 
 
 
448 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.66953  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3672  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.05 
 
 
680 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4749  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.05 
 
 
680 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.18263 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  25.71 
 
 
466 aa  83.2  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4094  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.31 
 
 
473 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2516  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.18 
 
 
451 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00442431  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2612  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.94 
 
 
451 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000540549  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  25.77 
 
 
466 aa  82.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.95 
 
 
468 aa  81.3  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.88 
 
 
457 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0867  flagellar hook-associated 2-like  24.34 
 
 
568 aa  80.9  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0994  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.81 
 
 
434 aa  80.9  0.00000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.864471  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.17 
 
 
465 aa  80.5  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  27.41 
 
 
498 aa  79.7  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.73 
 
 
453 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0666  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.6 
 
 
504 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201794 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1592  flagellar hook-associated protein 2  25.21 
 
 
665 aa  77.4  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.08 
 
 
475 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.53 
 
 
456 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0056  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.95 
 
 
458 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0383  flagellar hook-associated protein 2  25.21 
 
 
685 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374086  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.7 
 
 
473 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.42 
 
 
470 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  26.13 
 
 
471 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3160  putative flagellar hook-associated protein 2 (HAP2, fliD protein)  23.12 
 
 
572 aa  74.7  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0737875  normal  0.0817319 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1536  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.03 
 
 
499 aa  73.9  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.885136  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  25.06 
 
 
490 aa  73.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  23.86 
 
 
456 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3454  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.43 
 
 
448 aa  72  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1112  flagellar biosynthesis filament capping protein, enables filament assembly  25.06 
 
 
442 aa  71.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1449  flagellar hook-associated 2-like  27.03 
 
 
781 aa  72  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000641782  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  23.86 
 
 
454 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.88 
 
 
462 aa  72  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.91 
 
 
452 aa  72  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  23.97 
 
 
677 aa  71.2  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0708  flagellar hook-associated 2 domain protein  23.75 
 
 
571 aa  71.2  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.208024  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0761  flagellar hook-associated protein  28.57 
 
 
559 aa  70.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.86 
 
 
456 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1341  flagellar hook-associated protein 2-like  24.21 
 
 
452 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0133046  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2198  flagellar capping protein-like  24.03 
 
 
692 aa  69.3  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02914  Flagellar capping protein  21.52 
 
 
471 aa  68.9  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0732535  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3342  flagellar hook-associated protein 2  30.32 
 
 
472 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001172  flagellar hook-associated protein FliD  26.62 
 
 
445 aa  68.9  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0062  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.8 
 
 
472 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0277  lateral flagellar hook associated protein 2  25 
 
 
438 aa  68.2  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0170554  normal  0.892607 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.04 
 
 
457 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04956  flagellar capping protein  23.94 
 
 
437 aa  67.8  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.36 
 
 
455 aa  67  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.37 
 
 
457 aa  67.4  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2034  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.27 
 
 
449 aa  66.6  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.842459 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0032  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.34 
 
 
475 aa  67  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3357  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.94 
 
 
438 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.507353  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0764  flagellar filament cap protein FliD  27.75 
 
 
766 aa  65.9  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.702512  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.34 
 
 
657 aa  65.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2523  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.78 
 
 
472 aa  65.9  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  25.73 
 
 
477 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2833  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.67 
 
 
487 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140245  decreased coverage  0.00782764 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  22.51 
 
 
456 aa  64.3  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17060  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.08 
 
 
448 aa  62.8  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0186  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.53 
 
 
431 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175373  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7620  flagellar hook-associated protein 2  25 
 
 
500 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.238604 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2571  flagellar capping protein  24.13 
 
 
474 aa  60.8  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  22.11 
 
 
451 aa  60.5  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0835  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.38 
 
 
664 aa  60.5  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  23.9 
 
 
454 aa  60.5  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0114  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.09 
 
 
852 aa  59.7  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0176  flagellar hook-associated protein, putative  24.9 
 
 
438 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3937  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.11 
 
 
463 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0633  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.3 
 
 
467 aa  59.7  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000260812 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0092  flagellar capping protein  24.46 
 
 
607 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0573  flagellar capping protein  23.16 
 
 
642 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>