More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0835 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0835  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
586 aa  1154    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0311157 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1003  glycoside hydrolase family 3 protein  58.94 
 
 
481 aa  403  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.861392  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.69 
 
 
382 aa  334  2e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.05 
 
 
398 aa  316  9e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2172  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.5 
 
 
375 aa  300  7e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0719  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.25 
 
 
392 aa  293  8e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2055  glycosy hydrolase family protein  47.34 
 
 
378 aa  293  9e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.99 
 
 
379 aa  286  8e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0101171  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2578  glycoside hydrolase family 3 protein  43.12 
 
 
375 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1318  putative glycosyl hydrolase  44.28 
 
 
382 aa  277  4e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0717  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.55 
 
 
395 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2813  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.28 
 
 
375 aa  272  2e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.21 
 
 
373 aa  267  5e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1972  glycosy hydrolase family protein  41.28 
 
 
374 aa  266  1e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2414  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.78 
 
 
373 aa  259  7e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2069  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.62 
 
 
358 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.739108  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1193  hypothetical protein  39.76 
 
 
382 aa  255  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2357  glycoside hydrolase family 3 protein  41.8 
 
 
393 aa  253  8.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0168958  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1199  hypothetical protein  39.45 
 
 
382 aa  251  2e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0470  b-N-acetylglucosaminidase, glycoside hydrolase family 3 protein  38.37 
 
 
395 aa  248  2e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.65741 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0916  hypothetical protein  39.88 
 
 
358 aa  227  4e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0946  hypothetical protein  38.32 
 
 
358 aa  221  3.9999999999999997e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0601  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.42 
 
 
381 aa  197  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0823164 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.84 
 
 
365 aa  196  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.54 
 
 
365 aa  194  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  41.25 
 
 
365 aa  193  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  40 
 
 
631 aa  188  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  39.94 
 
 
365 aa  187  5e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0154  glycoside hydrolase family 3 protein  34.04 
 
 
351 aa  186  9e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  39.28 
 
 
618 aa  186  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0793  glycosy hydrolase family protein  34.87 
 
 
350 aa  186  1.0000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0989068  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  40.47 
 
 
656 aa  186  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  38.8 
 
 
511 aa  186  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0777  glycosy hydrolase family protein  29.1 
 
 
354 aa  182  1e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.696982  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.71 
 
 
543 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.75 
 
 
426 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  34.91 
 
 
444 aa  177  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  37.8 
 
 
604 aa  178  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.44 
 
 
558 aa  177  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  38.76 
 
 
427 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.76 
 
 
528 aa  174  5e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  39.5 
 
 
503 aa  173  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.5 
 
 
698 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  42.77 
 
 
420 aa  171  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.09 
 
 
387 aa  169  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.96 
 
 
543 aa  168  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.72 
 
 
600 aa  167  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  36.42 
 
 
633 aa  166  8e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  39.69 
 
 
552 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4457  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.77 
 
 
388 aa  166  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0149935  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.22 
 
 
594 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  36.05 
 
 
520 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  36.49 
 
 
492 aa  162  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  36.14 
 
 
498 aa  161  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  31.2 
 
 
517 aa  160  6e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00592  Beta-hexosaminidase A precursor  35.18 
 
 
673 aa  158  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10240  lipoprotein lpqI  41.39 
 
 
388 aa  156  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000940475  normal  0.839336 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  33.92 
 
 
845 aa  155  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  36.76 
 
 
499 aa  155  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  35.45 
 
 
490 aa  153  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.28 
 
 
484 aa  153  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.77 
 
 
490 aa  153  8e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.76 
 
 
504 aa  153  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  32.52 
 
 
520 aa  153  8.999999999999999e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.72 
 
 
537 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4512  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.71 
 
 
482 aa  151  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.625596  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.84 
 
 
596 aa  151  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4609  beta-hexosaminidase  32 
 
 
637 aa  150  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.28 
 
 
580 aa  150  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  35.49 
 
 
575 aa  150  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  0.0000631945 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01720  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  39.52 
 
 
383 aa  150  8e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.651137  normal  0.324393 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  31.93 
 
 
589 aa  150  9e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.06 
 
 
582 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0949  putative beta-hexosaminidase  32.44 
 
 
688 aa  148  3e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  31.37 
 
 
541 aa  147  6e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2180  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.21 
 
 
339 aa  146  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259276  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  31.67 
 
 
361 aa  146  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  34.81 
 
 
575 aa  146  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4021  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.46 
 
 
403 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0221723  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0484  glycoside hydrolase family 3 protein  29.94 
 
 
528 aa  145  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.299278  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  29.3 
 
 
363 aa  145  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0117  glycoside hydrolase family 3 protein  32.73 
 
 
465 aa  144  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.14 
 
 
953 aa  145  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  37.04 
 
 
990 aa  145  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0769  putative hydrolase glycosidase protein  35.14 
 
 
734 aa  144  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.527558  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.04 
 
 
976 aa  144  4e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0119  glycoside hydrolase family 3 protein  32.73 
 
 
467 aa  144  5e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4142  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.58 
 
 
598 aa  143  8e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0169  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.44 
 
 
573 aa  142  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.46 
 
 
511 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  37.17 
 
 
386 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.78 
 
 
354 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545461 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.55 
 
 
583 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.655452  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2825  beta-hexosaminidase  38.78 
 
 
354 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0638  putative beta-glucosidase  28.2 
 
 
531 aa  141  3e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00229499  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  35.49 
 
 
585 aa  141  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.83 
 
 
591 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351864  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.24 
 
 
365 aa  140  6e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0219  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.6 
 
 
397 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2109  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.57 
 
 
353 aa  139  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.302973 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>