99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0505 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1927  Beta-galactosidase  51.55 
 
 
679 aa  722    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000283864  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0607  Beta-galactosidase  53.44 
 
 
672 aa  763    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00254825  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0621  Beta-galactosidase  53.29 
 
 
672 aa  762    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.627864  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2642  Beta-galactosidase  47.81 
 
 
669 aa  689    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0505  Beta-galactosidase  100 
 
 
683 aa  1417    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000103563  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33200  beta-galactosidase  41.28 
 
 
686 aa  608  9.999999999999999e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105226  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0530  Beta-galactosidase  43.43 
 
 
672 aa  600  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1085  Beta-galactosidase  44.61 
 
 
672 aa  594  1e-168  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0829  Beta-galactosidase  43.27 
 
 
687 aa  586  1e-166  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000309351  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3322  Beta-galactosidase  41.87 
 
 
706 aa  577  1.0000000000000001e-163  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.511587  normal  0.0501254 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1976  Beta-galactosidase  41.23 
 
 
679 aa  578  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344903  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2451  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  41.35 
 
 
686 aa  561  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.987943  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0160  beta-galactosidase  41.01 
 
 
689 aa  553  1e-156  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0156  beta-galactosidase  41.29 
 
 
689 aa  553  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0051  Beta-galactosidase  40.57 
 
 
663 aa  546  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2891  Beta-galactosidase  40.9 
 
 
688 aa  543  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0224405  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1317  Beta-galactosidase  39.88 
 
 
686 aa  542  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00129022  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2962  Beta-galactosidase  39.74 
 
 
685 aa  540  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000633248  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0973  Beta-galactosidase  39.77 
 
 
686 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.815982  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0918  beta-galactosidase  39.77 
 
 
686 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.995798  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2995  Beta-galactosidase  39.11 
 
 
677 aa  536  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2397  Beta-galactosidase  38.15 
 
 
690 aa  538  1e-151  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.421729  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1280  Beta-galactosidase  39.65 
 
 
685 aa  533  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00156008  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4935  Beta-galactosidase  37.5 
 
 
639 aa  483  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0997823  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06550  beta-galactosidase  37.12 
 
 
687 aa  476  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.753424  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3022  Beta-galactosidase  37.33 
 
 
653 aa  473  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2736  Beta-galactosidase  35.29 
 
 
657 aa  471  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174628  normal  0.346028 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2173  Beta-galactosidase  36.89 
 
 
660 aa  471  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243153  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0378  Beta-galactosidase  36.49 
 
 
687 aa  468  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.946155  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2028  Beta-galactosidase  36.21 
 
 
697 aa  456  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.119513 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1064  Beta-galactosidase  34.49 
 
 
683 aa  455  1.0000000000000001e-126  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.113261  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7700  Beta-galactosidase  35.1 
 
 
667 aa  443  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0520455  normal  0.819106 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0311  Beta-galactosidase  36.6 
 
 
711 aa  440  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0181132  normal  0.0282735 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2151  Beta-galactosidase  34.45 
 
 
685 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.355264  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0617  Beta-galactosidase  34.78 
 
 
677 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4676  Beta-galactosidase  35.25 
 
 
680 aa  438  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645626  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0412  Beta-galactosidase  34.85 
 
 
662 aa  435  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.322295 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3325  Beta-galactosidase  35.82 
 
 
671 aa  431  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0011475  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1193  Beta-galactosidase  34.32 
 
 
684 aa  430  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377483  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3125  Beta-galactosidase  36.17 
 
 
671 aa  429  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0401597 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3970  Beta-galactosidase  33.92 
 
 
678 aa  428  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115571  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5560  Beta-galactosidase  34.07 
 
 
667 aa  426  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.3655 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03930  beta-galactosidase  34.52 
 
 
682 aa  424  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10120  beta-galactosidase  35.42 
 
 
697 aa  424  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0838655 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06640  beta-galactosidase  34.16 
 
 
701 aa  412  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.639566  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3076  Beta-galactosidase  34.06 
 
 
682 aa  409  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345923  normal  0.884247 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0926  beta-galactosidase  33.81 
 
 
691 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0833623  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03990  beta-galactosidase  35.35 
 
 
685 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1287  Beta-galactosidase  38.77 
 
 
701 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.686384  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3298  Beta-galactosidase  34.16 
 
 
681 aa  402  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452192  decreased coverage  0.00169341 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1615  beta-galactosidase  32.94 
 
 
663 aa  381  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0289359  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1316  Beta-galactosidase  32.03 
 
 
678 aa  378  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1764  Beta-galactosidase  32.38 
 
 
686 aa  372  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00394177  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1005  beta-galactosidase  32.89 
 
 
710 aa  364  2e-99  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.504738  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17050  beta-galactosidase  31.78 
 
 
686 aa  365  2e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.172156  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3892  Beta-galactosidase  29.53 
 
 
669 aa  330  6e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.113241  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3638  Beta-galactosidase  29.49 
 
 
644 aa  312  2e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0901  Beta-galactosidase  26.68 
 
 
685 aa  307  5.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.240206 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2868  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  29.42 
 
 
700 aa  304  4.0000000000000003e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0419  Beta-galactosidase  32.06 
 
 
609 aa  301  3e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2516  Beta-galactosidase  27.79 
 
 
670 aa  300  5e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1557  Beta-galactosidase  28.91 
 
 
649 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1623  Beta-galactosidase  28.91 
 
 
649 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.015305  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1938  Beta-galactosidase  28.14 
 
 
664 aa  275  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.949653  normal  0.422519 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2209  Beta-galactosidase  25.22 
 
 
711 aa  258  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0114104 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2323  Beta-galactosidase  25.4 
 
 
710 aa  251  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2648  Beta-galactosidase  24.86 
 
 
710 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4585  Beta-galactosidase  26.53 
 
 
660 aa  247  6e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2811  Beta-galactosidase  25.85 
 
 
646 aa  247  6e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.206861 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2015  Beta-galactosidase  26.88 
 
 
657 aa  246  9e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000219156  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5742  beta-galactosidase  26.36 
 
 
642 aa  245  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585873  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2829  Beta-galactosidase  29.86 
 
 
714 aa  242  2e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.130721  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3288  Beta-galactosidase  27.22 
 
 
656 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4877  Beta-galactosidase  27.22 
 
 
656 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.713772  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5486  Beta-galactosidase  25.64 
 
 
663 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761989  hitchhiker  0.000330975 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4931  Beta-galactosidase  26.11 
 
 
663 aa  240  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0648611 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2394  Beta-galactosidase  25.51 
 
 
645 aa  238  3e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4578  Beta-galactosidase  26.09 
 
 
664 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144299 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2352  Beta-galactosidase  27.42 
 
 
660 aa  237  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0870691  normal  0.136979 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3197  Beta-galactosidase  29.53 
 
 
661 aa  236  9e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271106  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5202  Beta-galactosidase  25.22 
 
 
664 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.856038  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3245  Beta-galactosidase  24.08 
 
 
673 aa  235  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5657  Beta-galactosidase  25.22 
 
 
664 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00663858  normal  0.40275 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6327  Beta-galactosidase  24.67 
 
 
656 aa  232  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6027  Beta-galactosidase  24.82 
 
 
656 aa  231  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330349  normal  0.994275 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3492  Beta-galactosidase  23.95 
 
 
635 aa  226  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2144  Beta-galactosidase  28.34 
 
 
652 aa  225  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.267505  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1239  beta-galactosidase  24.85 
 
 
635 aa  216  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.527812  normal  0.0426112 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3830  Beta-galactosidase  24.48 
 
 
632 aa  215  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247674  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2631  Beta-galactosidase  24.57 
 
 
701 aa  209  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.214804 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2635  Beta-galactosidase  23.34 
 
 
669 aa  198  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34520  beta-galactosidase  23.81 
 
 
693 aa  191  4e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.313325  normal  0.443852 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1831  Beta-galactosidase  23.28 
 
 
671 aa  179  2e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0845  Beta-galactosidase  21.97 
 
 
674 aa  169  2e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11630  beta-galactosidase  21.26 
 
 
699 aa  125  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0080  glycoside hydrolase family 42 protein  21.63 
 
 
715 aa  116  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0820956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3380  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  20.82 
 
 
699 aa  98.6  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5076  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  20.66 
 
 
713 aa  95.9  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.946735  normal  0.386552 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4433  hypothetical protein  25.91 
 
 
1088 aa  43.9  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0682487  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>