53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4433 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4433  hypothetical protein  100 
 
 
1088 aa  2248    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0682487  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2670  hypothetical protein  32.69 
 
 
329 aa  105  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.27895  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3004  hypothetical protein  29.51 
 
 
398 aa  102  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.978043  normal  0.100274 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0302  hypothetical protein  32.64 
 
 
264 aa  100  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0307  hypothetical protein  31.95 
 
 
264 aa  94.7  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0322  hypothetical protein  33.05 
 
 
264 aa  94.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0262  hypothetical protein  31.54 
 
 
264 aa  92  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2367  hypothetical protein  32.22 
 
 
263 aa  92.4  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0276  hypothetical protein  31.54 
 
 
264 aa  92  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0337  hypothetical protein  31.51 
 
 
264 aa  90.1  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0258  hypothetical protein  30.67 
 
 
263 aa  86.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0315  hypothetical protein  30.96 
 
 
263 aa  86.3  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0261  hypothetical protein  30.54 
 
 
263 aa  85.1  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1541  hypothetical protein  27.49 
 
 
346 aa  84.7  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293719 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0355  hypothetical protein  30.54 
 
 
263 aa  84.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00206633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2184  hypothetical protein  31.97 
 
 
260 aa  84  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000230279  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0329  hypothetical protein  30.67 
 
 
263 aa  84  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0192305  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2626  hypothetical protein  27.27 
 
 
324 aa  84  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0488948  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0268  hypothetical protein  28.74 
 
 
263 aa  83.2  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5862  hypothetical protein  26.44 
 
 
333 aa  82.4  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2182  hypothetical protein  30.65 
 
 
263 aa  81.6  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000712261  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4992  hypothetical protein  29.41 
 
 
263 aa  81.6  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0973009  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0032  hypothetical protein  30.17 
 
 
260 aa  81.3  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2476  hypothetical protein  29.59 
 
 
317 aa  81.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0706846  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0034  hypothetical protein  30.2 
 
 
263 aa  80.9  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2290  hypothetical protein  26.23 
 
 
322 aa  75.1  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0467088 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2632  hypothetical protein  31.53 
 
 
276 aa  72  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.107687  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3865  hypothetical protein  27.5 
 
 
329 aa  62.8  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288718  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0119  hypothetical protein  25.93 
 
 
222 aa  60.1  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.357638  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4094  hypothetical protein  25.82 
 
 
364 aa  59.7  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435077  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4435  hypothetical protein  23.24 
 
 
248 aa  58.2  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0707937  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3005  hypothetical protein  26.27 
 
 
274 aa  58.2  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0326681 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2391  hypothetical protein  24.6 
 
 
370 aa  55.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0926  beta-galactosidase  23.42 
 
 
691 aa  53.5  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0833623  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1005  beta-galactosidase  20.7 
 
 
710 aa  53.1  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.504738  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5028  hypothetical protein  25.51 
 
 
336 aa  50.8  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3022  Beta-galactosidase  20.93 
 
 
653 aa  50.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2323  Beta-galactosidase  22.17 
 
 
710 aa  50.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2631  Beta-galactosidase  25 
 
 
701 aa  50.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.214804 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0530  Beta-galactosidase  24.57 
 
 
672 aa  49.7  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3208  hypothetical protein  26.2 
 
 
365 aa  49.7  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3325  Beta-galactosidase  23.04 
 
 
671 aa  49.7  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0011475  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1237  hypothetical protein  27.84 
 
 
298 aa  48.9  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0333  hypothetical protein  23.01 
 
 
399 aa  48.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5657  Beta-galactosidase  23.42 
 
 
664 aa  45.8  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00663858  normal  0.40275 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5202  Beta-galactosidase  23.42 
 
 
664 aa  45.8  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.856038  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4578  Beta-galactosidase  23.42 
 
 
664 aa  45.8  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144299 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0973  Beta-galactosidase  21.49 
 
 
686 aa  45.1  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.815982  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0918  beta-galactosidase  21.49 
 
 
686 aa  45.1  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.995798  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4931  Beta-galactosidase  21.55 
 
 
663 aa  45.1  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0648611 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3380  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  24 
 
 
699 aa  45.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5486  Beta-galactosidase  22.29 
 
 
663 aa  45.1  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761989  hitchhiker  0.000330975 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34520  beta-galactosidase  21.76 
 
 
693 aa  44.7  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.313325  normal  0.443852 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>