36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5862 on replicon NC_011738
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011738  PCC7424_5862  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  669    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1541  hypothetical protein  58.56 
 
 
346 aa  394  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293719 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2290  hypothetical protein  37.36 
 
 
322 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0467088 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3004  hypothetical protein  29.18 
 
 
398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.978043  normal  0.100274 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2626  hypothetical protein  27.62 
 
 
324 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0488948  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3005  hypothetical protein  32.03 
 
 
274 aa  89.7  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0326681 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4094  hypothetical protein  28.76 
 
 
364 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435077  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4433  hypothetical protein  26.44 
 
 
1088 aa  82.4  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0682487  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3865  hypothetical protein  27.14 
 
 
329 aa  72.8  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288718  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5028  hypothetical protein  25.94 
 
 
336 aa  67  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3925  hypothetical protein  25.52 
 
 
350 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2391  hypothetical protein  25.38 
 
 
370 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0412  hypothetical protein  28.11 
 
 
356 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.862178  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1926  hypothetical protein  25.74 
 
 
318 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3919  hypothetical protein  26.07 
 
 
330 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.455905  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4088  hypothetical protein  26.07 
 
 
330 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00189441  normal  0.318027 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1453  hypothetical protein  23.56 
 
 
352 aa  52.8  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0743  FkbM family methyltransferase  24.75 
 
 
661 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.70648  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0333  hypothetical protein  24.56 
 
 
399 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1448  hypothetical protein  20.83 
 
 
372 aa  50.8  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.115033  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2166  hypothetical protein  29.7 
 
 
389 aa  50.8  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.126428  normal  0.128971 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0014  hypothetical protein  23.7 
 
 
367 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869851  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1773  hypothetical protein  22.12 
 
 
787 aa  49.3  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.488982 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4426  hypothetical protein  25.38 
 
 
385 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3999  nitroreductase  21.15 
 
 
394 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.483362  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0150  hypothetical protein  25.5 
 
 
365 aa  46.6  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493926  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0510  hypothetical protein  28.82 
 
 
388 aa  46.2  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3210  hypothetical protein  24.51 
 
 
361 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3184  hypothetical protein  24.07 
 
 
382 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0629  hypothetical protein  55.88 
 
 
431 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1237  hypothetical protein  24.4 
 
 
298 aa  44.3  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5633  hypothetical protein  25.35 
 
 
365 aa  43.5  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3208  hypothetical protein  24.26 
 
 
365 aa  43.1  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2447  hypothetical protein  26.97 
 
 
356 aa  43.1  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0508  hypothetical protein  25.08 
 
 
337 aa  43.1  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.387565  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0634  hypothetical protein  54.29 
 
 
422 aa  43.1  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>