36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1541 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1541  hypothetical protein  100 
 
 
346 aa  705    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293719 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5862  hypothetical protein  58.08 
 
 
333 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2290  hypothetical protein  35.23 
 
 
322 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0467088 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2626  hypothetical protein  26.2 
 
 
324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0488948  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3004  hypothetical protein  30.04 
 
 
398 aa  100  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.978043  normal  0.100274 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4094  hypothetical protein  28.76 
 
 
364 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435077  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4433  hypothetical protein  27.49 
 
 
1088 aa  87.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0682487  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3005  hypothetical protein  29.41 
 
 
274 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0326681 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5028  hypothetical protein  28.57 
 
 
336 aa  83.2  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3865  hypothetical protein  27.27 
 
 
329 aa  80.9  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288718  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1453  hypothetical protein  24.32 
 
 
352 aa  63.2  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0743  FkbM family methyltransferase  28.64 
 
 
661 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.70648  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0412  hypothetical protein  28.24 
 
 
356 aa  56.2  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.862178  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2391  hypothetical protein  24.33 
 
 
370 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3925  hypothetical protein  25.68 
 
 
350 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2166  hypothetical protein  27.16 
 
 
389 aa  54.3  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.126428  normal  0.128971 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0014  hypothetical protein  31.13 
 
 
367 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869851  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1448  hypothetical protein  22.66 
 
 
372 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.115033  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00972  hypothetical protein  31.65 
 
 
447 aa  51.2  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.482043  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3919  hypothetical protein  29.11 
 
 
330 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.455905  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4088  hypothetical protein  29.11 
 
 
330 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00189441  normal  0.318027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0634  hypothetical protein  26.35 
 
 
422 aa  50.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1926  hypothetical protein  51.11 
 
 
318 aa  50.4  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3999  nitroreductase  23.24 
 
 
394 aa  50.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.483362  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48544  predicted protein  29.17 
 
 
462 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.593609  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48545  predicted protein  26.85 
 
 
471 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0458637  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3184  hypothetical protein  24.06 
 
 
382 aa  47.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3210  hypothetical protein  29.25 
 
 
361 aa  47.4  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0629  hypothetical protein  24.27 
 
 
431 aa  47  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3208  hypothetical protein  26.11 
 
 
365 aa  46.6  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0150  hypothetical protein  51.11 
 
 
365 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493926  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0333  hypothetical protein  24.56 
 
 
399 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5633  hypothetical protein  51.35 
 
 
365 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3442  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  24.3 
 
 
333 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00066562  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4418  hypothetical protein  24.18 
 
 
372 aa  43.1  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.587886  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1773  hypothetical protein  24.2 
 
 
787 aa  42.7  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.488982 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>