14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3442 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3442  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  100 
 
 		 333 aa  680    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00066562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3986  hypothetical protein  81.93 
 
 		 333 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.077735  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2562  hypothetical protein  33.33 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2626  hypothetical protein  26.32 
 
 		 324 aa  52.8  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0488948  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2391  hypothetical protein  25.74 
 
 		 370 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2166  hypothetical protein  27.27 
 
 		 389 aa  50.1  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.126428  normal  0.128971 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3368  hypothetical protein  30.92 
 
 		 304 aa  47  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1455  hypothetical protein  40.62 
 
 		 343 aa  47  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1606  hypothetical protein  26.55 
 
 		 391 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4094  hypothetical protein  27.31 
 
 		 364 aa  45.8  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1237  hypothetical protein  27.81 
 
 		 298 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0510  hypothetical protein  29.03 
 
 		 388 aa  43.5  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1541  hypothetical protein  24.3 
 
 		 346 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293719 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3004  hypothetical protein  25.19 
 
 		 398 aa  43.1  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.978043  normal  0.100274 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>