36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2626 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2626  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  669    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0488948  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2290  hypothetical protein  30.68 
 
 
322 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0467088 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1541  hypothetical protein  26.2 
 
 
346 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293719 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3004  hypothetical protein  27.33 
 
 
398 aa  106  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.978043  normal  0.100274 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5862  hypothetical protein  27.62 
 
 
333 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3005  hypothetical protein  27.34 
 
 
274 aa  89  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0326681 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4433  hypothetical protein  27.27 
 
 
1088 aa  84.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0682487  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3925  hypothetical protein  29.23 
 
 
350 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1606  hypothetical protein  23.34 
 
 
391 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4094  hypothetical protein  22.94 
 
 
364 aa  65.9  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435077  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5028  hypothetical protein  26.76 
 
 
336 aa  65.1  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3919  hypothetical protein  27.23 
 
 
330 aa  62.8  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.455905  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4088  hypothetical protein  27.23 
 
 
330 aa  62.8  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00189441  normal  0.318027 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2562  hypothetical protein  27.15 
 
 
342 aa  62  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3210  hypothetical protein  25 
 
 
361 aa  60.5  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3208  hypothetical protein  26.55 
 
 
365 aa  59.7  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3865  hypothetical protein  29.63 
 
 
329 aa  59.7  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288718  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5633  hypothetical protein  24.17 
 
 
365 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4426  hypothetical protein  27.24 
 
 
385 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00972  hypothetical protein  31.85 
 
 
447 aa  53.9  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.482043  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3442  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.32 
 
 
333 aa  52.8  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00066562  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3184  hypothetical protein  24.71 
 
 
382 aa  50.8  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0014  hypothetical protein  25.54 
 
 
367 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869851  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1926  hypothetical protein  22.96 
 
 
318 aa  50.1  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2391  hypothetical protein  23.24 
 
 
370 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0333  hypothetical protein  22.19 
 
 
399 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0634  hypothetical protein  23.6 
 
 
422 aa  46.2  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48545  predicted protein  25.93 
 
 
471 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0458637  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48544  predicted protein  28.99 
 
 
462 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.593609  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3219  hypothetical protein  29.03 
 
 
329 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0629  hypothetical protein  25.1 
 
 
431 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3986  hypothetical protein  26.73 
 
 
333 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.077735  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0150  hypothetical protein  23.58 
 
 
365 aa  44.3  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493926  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1237  hypothetical protein  22.11 
 
 
298 aa  44.3  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0412  hypothetical protein  22.26 
 
 
356 aa  43.1  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.862178  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0508  hypothetical protein  45.95 
 
 
337 aa  42.7  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.387565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>