30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3004 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3004  hypothetical protein  100 
 
 		 398 aa  825    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.978043  normal  0.100274 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3005  hypothetical protein  36.7 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0326681 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5862  hypothetical protein  29.18 
 
 		 333 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2626  hypothetical protein  27.33 
 
 		 324 aa  106  9e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0488948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4433  hypothetical protein  29.51 
 
 		 1088 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0682487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1541  hypothetical protein  30.04 
 
 		 346 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293719 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2290  hypothetical protein  28.1 
 
 		 322 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0467088 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5028  hypothetical protein  28.1 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3865  hypothetical protein  31.09 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1606  hypothetical protein  23.2 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4094  hypothetical protein  26.51 
 
 		 364 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48544  predicted protein  28.26 
 
 		 462 aa  57  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.593609  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3219  hypothetical protein  28.34 
 
 		 329 aa  57  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3925  hypothetical protein  24.22 
 
 		 350 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4088  hypothetical protein  21.58 
 
 		 330 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00189441  normal  0.318027 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3919  hypothetical protein  21.58 
 
 		 330 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.455905  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48545  predicted protein  29.66 
 
 		 471 aa  53.1  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0458637  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2166  hypothetical protein  33.09 
 
 		 389 aa  50.8  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.126428  normal  0.128971 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2562  hypothetical protein  24.78 
 
 		 342 aa  50.4  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3210  hypothetical protein  26.67 
 
 		 361 aa  50.4  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4426  hypothetical protein  26.09 
 
 		 385 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00972  hypothetical protein  29.77 
 
 		 447 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.482043  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5633  hypothetical protein  26.16 
 
 		 365 aa  47  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0412  hypothetical protein  25 
 
 		 356 aa  47  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.862178  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1237  hypothetical protein  23.71 
 
 		 298 aa  46.2  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3208  hypothetical protein  24.75 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0507  hypothetical protein  23.08 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.363436  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0510  hypothetical protein  31.65 
 
 		 388 aa  43.5  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3442  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.19 
 
 		 333 aa  43.1  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00066562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2391  hypothetical protein  22.04 
 
 		 370 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>