19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1926 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1926  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  665    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00972  hypothetical protein  26.11 
 
 		 447 aa  67.4  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.482043  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1237  hypothetical protein  25.27 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5862  hypothetical protein  25.74 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3005  hypothetical protein  22.58 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0326681 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4094  hypothetical protein  27.15 
 
 		 364 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1541  hypothetical protein  51.11 
 
 		 346 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293719 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2626  hypothetical protein  22.96 
 
 		 324 aa  50.1  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0488948  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3865  hypothetical protein  28.12 
 
 		 329 aa  49.7  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0532  hypothetical protein  27.66 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3184  hypothetical protein  24.6 
 
 		 382 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3208  hypothetical protein  26.79 
 
 		 365 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5633  hypothetical protein  27.27 
 
 		 365 aa  47  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0014  hypothetical protein  54.29 
 
 		 367 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869851  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2290  hypothetical protein  26.39 
 
 		 322 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0467088 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3986  hypothetical protein  25 
 
 		 333 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.077735  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0634  hypothetical protein  39.13 
 
 		 422 aa  42.7  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3004  hypothetical protein  21.17 
 
 		 398 aa  42.7  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.978043  normal  0.100274 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2391  hypothetical protein  22.16 
 
 		 370 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>