14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3208 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3208  hypothetical protein  100 
 
 		 365 aa  749    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3210  hypothetical protein  40.57 
 
 		 361 aa  195  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00972  hypothetical protein  33.2 
 
 		 447 aa  95.9  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.482043  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3005  hypothetical protein  26.61 
 
 		 274 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0326681 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2626  hypothetical protein  26.55 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0488948  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4094  hypothetical protein  23.5 
 
 		 364 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3219  hypothetical protein  36.03 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4433  hypothetical protein  26.2 
 
 		 1088 aa  49.7  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0682487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2290  hypothetical protein  23.24 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0467088 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1926  hypothetical protein  26.79 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1541  hypothetical protein  26.34 
 
 		 346 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293719 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0510  hypothetical protein  29.45 
 
 		 388 aa  46.6  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3004  hypothetical protein  24.75 
 
 		 398 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.978043  normal  0.100274 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5862  hypothetical protein  24.26 
 
 		 333 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>