13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3210 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3210  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  748    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3208  hypothetical protein  40.57 
 
 		 365 aa  195  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00972  hypothetical protein  26.72 
 
 		 447 aa  84.3  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.482043  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2626  hypothetical protein  25 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0488948  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2166  hypothetical protein  29.32 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.126428  normal  0.128971 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3004  hypothetical protein  26.67 
 
 		 398 aa  50.4  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.978043  normal  0.100274 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3005  hypothetical protein  26.05 
 
 		 274 aa  49.7  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0326681 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2290  hypothetical protein  22.76 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0467088 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1541  hypothetical protein  29.25 
 
 		 346 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293719 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5862  hypothetical protein  24.51 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0634  hypothetical protein  26.02 
 
 		 422 aa  43.5  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0014  hypothetical protein  45.95 
 
 		 367 aa  43.1  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869851  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3219  hypothetical protein  28.06 
 
 		 329 aa  42.7  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>