32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2290 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2290  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  654    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0467088 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5862  hypothetical protein  37.36 
 
 
333 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1541  hypothetical protein  34.97 
 
 
346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293719 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2626  hypothetical protein  30.68 
 
 
324 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0488948  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3004  hypothetical protein  28.1 
 
 
398 aa  97.1  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.978043  normal  0.100274 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4094  hypothetical protein  28.9 
 
 
364 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435077  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4433  hypothetical protein  26.23 
 
 
1088 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0682487  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3005  hypothetical protein  27.46 
 
 
274 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0326681 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5028  hypothetical protein  27.31 
 
 
336 aa  69.7  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0412  hypothetical protein  28.28 
 
 
356 aa  66.2  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.862178  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2391  hypothetical protein  24.84 
 
 
370 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3999  nitroreductase  25.42 
 
 
394 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.483362  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3184  hypothetical protein  27.34 
 
 
382 aa  57.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0634  hypothetical protein  22.75 
 
 
422 aa  56.2  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5633  hypothetical protein  24.57 
 
 
365 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0333  hypothetical protein  25 
 
 
399 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00972  hypothetical protein  26.17 
 
 
447 aa  52  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.482043  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1448  hypothetical protein  21.8 
 
 
372 aa  51.2  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.115033  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2166  hypothetical protein  28.3 
 
 
389 aa  50.1  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.126428  normal  0.128971 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3865  hypothetical protein  21.85 
 
 
329 aa  50.1  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288718  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3925  hypothetical protein  26.22 
 
 
350 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3210  hypothetical protein  22.76 
 
 
361 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3208  hypothetical protein  23.24 
 
 
365 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4426  hypothetical protein  24.84 
 
 
385 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0508  hypothetical protein  31.17 
 
 
337 aa  47.4  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.387565  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0629  hypothetical protein  31.03 
 
 
431 aa  46.6  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2562  hypothetical protein  26.11 
 
 
342 aa  45.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1606  hypothetical protein  23.46 
 
 
391 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1773  hypothetical protein  23.57 
 
 
787 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.488982 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1926  hypothetical protein  26.39 
 
 
318 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1453  hypothetical protein  23.84 
 
 
352 aa  43.9  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2447  hypothetical protein  25.77 
 
 
356 aa  43.1  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>