36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1773 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1773  hypothetical protein  100 
 
 		 787 aa  1630    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.488982 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3270  hypothetical protein  38.67 
 
 		 394 aa  222  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1774  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.18 
 
 		 377 aa  216  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.201895  normal  0.343819 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3262  hypothetical protein  38.56 
 
 		 614 aa  214  4.9999999999999996e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.89048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0499  hypothetical protein  36.81 
 
 		 333 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3268  hypothetical protein  31.21 
 
 		 338 aa  153  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.893529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1771  hypothetical protein  30.93 
 
 		 313 aa  140  8.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.372685 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0836  hypothetical protein  30.94 
 
 		 320 aa  123  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.102237 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4855  hypothetical protein  30.03 
 
 		 349 aa  119  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2606  hypothetical protein  30.57 
 
 		 328 aa  107  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1056  hypothetical protein  28.62 
 
 		 416 aa  94  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496515  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0541  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 		 416 aa  93.2  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1816  hypothetical protein  29.05 
 
 		 600 aa  90.1  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.122136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5022  hypothetical protein  27.34 
 
 		 304 aa  82.4  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.841987 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2129  hypothetical protein  24.91 
 
 		 289 aa  66.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5028  hypothetical protein  23.53 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3923  protein of unknown function DUF23  24.35 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4094  hypothetical protein  30.37 
 
 		 364 aa  54.3  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0115  protein of unknown function DUF23  26.07 
 
 		 401 aa  54.3  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1648  hypothetical protein  44 
 
 		 312 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.964426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0743  FkbM family methyltransferase  23.56 
 
 		 661 aa  52.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.70648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3140  hypothetical protein  27.55 
 
 		 340 aa  52  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.999402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3412  hypothetical protein  28.43 
 
 		 340 aa  52  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3695  hypothetical protein  25.23 
 
 		 248 aa  51.6  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3473  glycosyl transferase family protein  25.38 
 
 		 281 aa  51.6  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5862  hypothetical protein  22.12 
 
 		 333 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2772  hypothetical protein  22.37 
 
 		 412 aa  48.9  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.225588  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3184  hypothetical protein  26.47 
 
 		 382 aa  47  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0386  fucolectin tachylectin-4 pentraxin-1  24.62 
 
 		 465 aa  47.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49130  predicted protein  26.56 
 
 		 472 aa  46.6  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1591  hypothetical protein  51.35 
 
 		 314 aa  45.8  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494173  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1872  hypothetical protein  51.35 
 
 		 314 aa  45.4  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.125812 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48287  predicted protein  26.32 
 
 		 839 aa  45.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323261  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48279  predicted protein  26.32 
 
 		 839 aa  45.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2290  hypothetical protein  23.57 
 
 		 322 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0467088 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2953  hypothetical protein  26.32 
 
 		 328 aa  44.7  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105956 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>