22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3695 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3695  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  509  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2772  hypothetical protein  32.2 
 
 		 412 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.225588  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1056  hypothetical protein  34.55 
 
 		 416 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496515  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3473  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 		 281 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0541  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 		 416 aa  102  7e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2606  hypothetical protein  31.68 
 
 		 328 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4855  hypothetical protein  27.03 
 
 		 349 aa  91.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0115  protein of unknown function DUF23  25 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2129  hypothetical protein  26.64 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3923  protein of unknown function DUF23  26 
 
 		 286 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5022  hypothetical protein  28.85 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.841987 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1816  hypothetical protein  28.39 
 
 		 600 aa  67.8  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.122136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0499  hypothetical protein  25.84 
 
 		 333 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1741  hypothetical protein  26.12 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0656009  normal  0.258144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1771  hypothetical protein  25.23 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.372685 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4517  hypothetical protein  38.36 
 
 		 461 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1774  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.91 
 
 		 377 aa  53.5  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.201895  normal  0.343819 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3262  hypothetical protein  25.29 
 
 		 614 aa  52  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.89048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1773  hypothetical protein  25.23 
 
 		 787 aa  51.6  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.488982 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0386  fucolectin tachylectin-4 pentraxin-1  26.98 
 
 		 465 aa  46.2  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0382  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  30 
 
 		 844 aa  43.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.97387  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3270  hypothetical protein  23.19 
 
 		 394 aa  42.4  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>