33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2129 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2129  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  587  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3923  protein of unknown function DUF23  90.11 
 
 		 286 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1056  hypothetical protein  35.32 
 
 		 416 aa  123  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496515  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0541  glycosyl transferase family protein  35.32 
 
 		 416 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2772  hypothetical protein  30.77 
 
 		 412 aa  112  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.225588  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0115  protein of unknown function DUF23  29.55 
 
 		 401 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5022  hypothetical protein  28.15 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.841987 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3473  glycosyl transferase family protein  33.75 
 
 		 281 aa  102  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4855  hypothetical protein  31.09 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3695  hypothetical protein  26.64 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2606  hypothetical protein  29.18 
 
 		 328 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0499  hypothetical protein  28.83 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1773  hypothetical protein  24.91 
 
 		 787 aa  66.2  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.488982 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1648  hypothetical protein  31.43 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.964426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1741  hypothetical protein  24.14 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0656009  normal  0.258144 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0386  fucolectin tachylectin-4 pentraxin-1  26.78 
 
 		 465 aa  59.3  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1774  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.55 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.201895  normal  0.343819 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1816  hypothetical protein  26.83 
 
 		 600 aa  57.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.122136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1872  hypothetical protein  30.56 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.125812 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1591  hypothetical protein  29.22 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494173  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4517  hypothetical protein  28.28 
 
 		 461 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3268  hypothetical protein  26.48 
 
 		 338 aa  53.1  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.893529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0836  hypothetical protein  30.77 
 
 		 320 aa  50.8  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.102237 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49130  predicted protein  31.82 
 
 		 472 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3412  hypothetical protein  24.32 
 
 		 340 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3270  hypothetical protein  25.69 
 
 		 394 aa  47.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3262  hypothetical protein  24.91 
 
 		 614 aa  47  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.89048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0382  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.59 
 
 		 844 aa  46.6  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.97387  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3095  glycosyl transferase family protein  32.38 
 
 		 286 aa  47  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44250  predicted protein  31.15 
 
 		 871 aa  46.2  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3140  hypothetical protein  24.84 
 
 		 340 aa  45.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.999402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3927  hypothetical protein  35.35 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.718732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1771  hypothetical protein  26.51 
 
 		 313 aa  42.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.372685 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>