17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1741 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1741  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  622  1e-177  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0656009  normal  0.258144 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0115  protein of unknown function DUF23  23.97 
 
 
401 aa  75.5  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1056  hypothetical protein  23.62 
 
 
416 aa  73.9  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496515  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0541  glycosyl transferase family protein  23.99 
 
 
416 aa  72  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4855  hypothetical protein  25.65 
 
 
349 aa  70.1  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3473  glycosyl transferase family protein  23.83 
 
 
281 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0836  hypothetical protein  25 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.102237 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2606  hypothetical protein  24.14 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1816  hypothetical protein  24.46 
 
 
600 aa  62  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.122136  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2129  hypothetical protein  24.14 
 
 
289 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3695  hypothetical protein  26.12 
 
 
248 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3923  protein of unknown function DUF23  24.46 
 
 
286 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5022  hypothetical protein  22.96 
 
 
304 aa  56.2  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.841987 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2772  hypothetical protein  25.18 
 
 
412 aa  52.8  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.225588  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0499  hypothetical protein  20.58 
 
 
333 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3270  hypothetical protein  20.17 
 
 
394 aa  42.7  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2294  hypothetical protein  23.81 
 
 
341 aa  42.7  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0157947  normal  0.294588 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>