22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0836 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0836  hypothetical protein  100 
 
 
320 aa  663    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.102237 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0499  hypothetical protein  32.33 
 
 
333 aa  143  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3270  hypothetical protein  33.83 
 
 
394 aa  142  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3262  hypothetical protein  32.64 
 
 
614 aa  134  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.89048  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1773  hypothetical protein  30.94 
 
 
787 aa  123  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.488982 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3268  hypothetical protein  30.11 
 
 
338 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.893529  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1774  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.21 
 
 
377 aa  95.5  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.201895  normal  0.343819 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1771  hypothetical protein  27.53 
 
 
313 aa  85.9  9e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.372685 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2606  hypothetical protein  27.48 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1816  hypothetical protein  29.34 
 
 
600 aa  77  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.122136  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1056  hypothetical protein  27.44 
 
 
416 aa  70.9  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496515  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1741  hypothetical protein  25 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0656009  normal  0.258144 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0541  glycosyl transferase family protein  26.14 
 
 
416 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4855  hypothetical protein  26.36 
 
 
349 aa  64.3  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3473  glycosyl transferase family protein  21.16 
 
 
281 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4517  hypothetical protein  24.9 
 
 
461 aa  62  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2772  hypothetical protein  31.14 
 
 
412 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.225588  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5022  hypothetical protein  24.9 
 
 
304 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.841987 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3923  protein of unknown function DUF23  33.08 
 
 
286 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0386  fucolectin tachylectin-4 pentraxin-1  23.23 
 
 
465 aa  51.2  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2129  hypothetical protein  30.77 
 
 
289 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0849  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 
336 aa  42.7  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>