25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4517 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4517  hypothetical protein  100 
 
 		 461 aa  968    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0386  fucolectin tachylectin-4 pentraxin-1  33.9 
 
 		 465 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2732  methyltransferase FkbM family  45.14 
 
 		 361 aa  123  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2772  hypothetical protein  29.7 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.225588  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1056  hypothetical protein  30.18 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496515  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0541  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 		 416 aa  73.2  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2733  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.66 
 
 		 778 aa  70.5  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0983  FkbM family methyltransferase  31.37 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0836  hypothetical protein  24.9 
 
 		 320 aa  62  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.102237 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0115  protein of unknown function DUF23  23.11 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3849  hypothetical protein  29.63 
 
 		 509 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.430064 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3212  coagulation factor 5/8 type-like  33.67 
 
 		 425 aa  59.3  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3709  hypothetical protein  30.72 
 
 		 818 aa  56.6  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.156868 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2462  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.1 
 
 		 820 aa  55.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00583202  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1997  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.54 
 
 		 541 aa  55.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2129  hypothetical protein  28.28 
 
 		 289 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3695  hypothetical protein  38.36 
 
 		 248 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3923  protein of unknown function DUF23  27.27 
 
 		 286 aa  54.3  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3473  glycosyl transferase family protein  25.31 
 
 		 281 aa  53.5  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1816  hypothetical protein  26.62 
 
 		 600 aa  52.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.122136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4855  hypothetical protein  20.46 
 
 		 349 aa  51.6  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2466  hypothetical protein  24.76 
 
 		 940 aa  47  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5022  hypothetical protein  22.46 
 
 		 304 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.841987 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1182  hypothetical protein  25.73 
 
 		 414 aa  43.9  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49130  predicted protein  31.25 
 
 		 472 aa  43.9  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>