32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5022 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_5022  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  640    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.841987 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1056  hypothetical protein  32.38 
 
 		 416 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496515  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0541  glycosyl transferase family protein  31.21 
 
 		 416 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2129  hypothetical protein  28.15 
 
 		 289 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3923  protein of unknown function DUF23  28.41 
 
 		 286 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2772  hypothetical protein  29.44 
 
 		 412 aa  95.9  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.225588  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1773  hypothetical protein  27.34 
 
 		 787 aa  82.4  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.488982 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3473  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 		 281 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4855  hypothetical protein  27.38 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0115  protein of unknown function DUF23  27.23 
 
 		 401 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3695  hypothetical protein  28.85 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2606  hypothetical protein  27.97 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0386  fucolectin tachylectin-4 pentraxin-1  30.25 
 
 		 465 aa  73.9  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1872  hypothetical protein  26.64 
 
 		 314 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.125812 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1648  hypothetical protein  33.93 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.964426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1591  hypothetical protein  23.59 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494173  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1774  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.4 
 
 		 377 aa  62.4  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.201895  normal  0.343819 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1816  hypothetical protein  26.61 
 
 		 600 aa  60.8  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.122136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3262  hypothetical protein  24.4 
 
 		 614 aa  60.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.89048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0499  hypothetical protein  25.3 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0836  hypothetical protein  24.9 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.102237 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1741  hypothetical protein  22.96 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0656009  normal  0.258144 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3268  hypothetical protein  27.82 
 
 		 338 aa  55.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.893529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1512  hypothetical protein  31.15 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3270  hypothetical protein  23.89 
 
 		 394 aa  47.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49130  predicted protein  28.17 
 
 		 472 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4517  hypothetical protein  22.46 
 
 		 461 aa  45.8  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48279  predicted protein  22.58 
 
 		 839 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48287  predicted protein  22.58 
 
 		 839 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323261  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1436  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  32.71 
 
 		 313 aa  43.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2294  hypothetical protein  29.09 
 
 		 341 aa  42.7  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0157947  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3140  hypothetical protein  32.39 
 
 		 340 aa  42.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.999402  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>