21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3270 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3270  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  804    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3262  hypothetical protein  44.41 
 
 		 614 aa  266  4e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.89048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1773  hypothetical protein  38.67 
 
 		 787 aa  222  7e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.488982 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1774  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.58 
 
 		 377 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.201895  normal  0.343819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0499  hypothetical protein  32.44 
 
 		 333 aa  156  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0836  hypothetical protein  33.83 
 
 		 320 aa  142  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.102237 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3268  hypothetical protein  27.59 
 
 		 338 aa  130  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.893529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1771  hypothetical protein  27.22 
 
 		 313 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.372685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4855  hypothetical protein  29.59 
 
 		 349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0541  glycosyl transferase family protein  28.2 
 
 		 416 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1056  hypothetical protein  27.24 
 
 		 416 aa  84  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496515  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1816  hypothetical protein  27.08 
 
 		 600 aa  80.9  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.122136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2606  hypothetical protein  24.15 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0115  protein of unknown function DUF23  22.67 
 
 		 401 aa  63.2  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3473  glycosyl transferase family protein  22.51 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2772  hypothetical protein  25.51 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.225588  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2054  glycosyltransferase  23.53 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5022  hypothetical protein  23.89 
 
 		 304 aa  47.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.841987 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2129  hypothetical protein  25.69 
 
 		 289 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3923  protein of unknown function DUF23  25.69 
 
 		 286 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1741  hypothetical protein  20.17 
 
 		 299 aa  42.7  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0656009  normal  0.258144 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>