27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0115 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0115  protein of unknown function DUF23  100 
 
 
401 aa  834    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2772  hypothetical protein  38.89 
 
 
412 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.225588  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1056  hypothetical protein  28.8 
 
 
416 aa  133  5e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496515  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0541  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
416 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4855  hypothetical protein  30.6 
 
 
349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2129  hypothetical protein  29.55 
 
 
289 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3923  protein of unknown function DUF23  28.44 
 
 
286 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2606  hypothetical protein  28.81 
 
 
328 aa  98.6  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3473  glycosyl transferase family protein  23.35 
 
 
281 aa  87  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3695  hypothetical protein  25 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5022  hypothetical protein  27.23 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.841987 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1741  hypothetical protein  23.97 
 
 
299 aa  75.5  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0656009  normal  0.258144 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0499  hypothetical protein  28.22 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1816  hypothetical protein  23.62 
 
 
600 aa  66.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.122136  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3270  hypothetical protein  22.67 
 
 
394 aa  63.2  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4517  hypothetical protein  23.11 
 
 
461 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3262  hypothetical protein  23.26 
 
 
614 aa  61.2  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.89048  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1774  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.62 
 
 
377 aa  55.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.201895  normal  0.343819 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1773  hypothetical protein  26.07 
 
 
787 aa  54.3  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.488982 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0386  fucolectin tachylectin-4 pentraxin-1  22.45 
 
 
465 aa  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44250  predicted protein  29.45 
 
 
871 aa  50.8  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1872  hypothetical protein  22.6 
 
 
314 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.125812 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1591  hypothetical protein  22.6 
 
 
314 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494173  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3268  hypothetical protein  24.79 
 
 
338 aa  48.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.893529  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4162  hypothetical protein  27.88 
 
 
360 aa  46.2  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.6055  normal  0.532094 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1648  hypothetical protein  23.08 
 
 
312 aa  44.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.964426  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0376  glycosyl transferase family protein  25.44 
 
 
267 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>