26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1774 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1774  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 		 377 aa  783    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.201895  normal  0.343819 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1773  hypothetical protein  34.18 
 
 		 787 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.488982 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0499  hypothetical protein  37.7 
 
 		 333 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3270  hypothetical protein  34.58 
 
 		 394 aa  173  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3262  hypothetical protein  32.36 
 
 		 614 aa  171  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.89048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1771  hypothetical protein  32.79 
 
 		 313 aa  145  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.372685 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3268  hypothetical protein  30.91 
 
 		 338 aa  136  7.000000000000001e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.893529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4855  hypothetical protein  32.92 
 
 		 349 aa  95.9  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0836  hypothetical protein  29.21 
 
 		 320 aa  95.5  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.102237 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1816  hypothetical protein  29.08 
 
 		 600 aa  88.6  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.122136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2606  hypothetical protein  24.9 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0541  glycosyl transferase family protein  25.36 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5022  hypothetical protein  28.4 
 
 		 304 aa  62.4  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.841987 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1056  hypothetical protein  25.64 
 
 		 416 aa  61.6  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496515  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2129  hypothetical protein  26.55 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3923  protein of unknown function DUF23  24.63 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0115  protein of unknown function DUF23  24.62 
 
 		 401 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2772  hypothetical protein  24.15 
 
 		 412 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.225588  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3473  glycosyl transferase family protein  23.72 
 
 		 281 aa  53.9  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3695  hypothetical protein  25.91 
 
 		 248 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1648  hypothetical protein  31.13 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.964426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0382  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  28.89 
 
 		 844 aa  44.7  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.97387  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1591  hypothetical protein  27.62 
 
 		 314 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494173  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1872  hypothetical protein  29.71 
 
 		 314 aa  44.3  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.125812 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4162  hypothetical protein  28.43 
 
 		 360 aa  43.5  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.6055  normal  0.532094 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0413  hypothetical protein  27.17 
 
 		 362 aa  43.1  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>