16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4162 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4162  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  747    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.6055  normal  0.532094 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2758  hypothetical protein  26.06 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3412  hypothetical protein  24.41 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3140  hypothetical protein  26.47 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.999402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2093  glycosyl transferase family 2  37.65 
 
 		 282 aa  52  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  32.73 
 
 		 358 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0413  hypothetical protein  21.39 
 
 		 362 aa  47  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0115  protein of unknown function DUF23  27.88 
 
 		 401 aa  46.2  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0017  hypothetical protein  26.54 
 
 		 353 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.129406  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2557  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 		 354 aa  44.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3095  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 		 286 aa  44.3  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1774  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.43 
 
 		 377 aa  43.9  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.201895  normal  0.343819 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2294  hypothetical protein  26.14 
 
 		 341 aa  43.9  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0157947  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4606  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 		 267 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1410  glycosyl transferase family protein  26.54 
 
 		 826 aa  42.7  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0402  hypothetical protein  21.19 
 
 		 330 aa  42.7  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>