121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3095 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3095  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
286 aa  579  1e-164  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1216  methyltransferase type 11  34.8 
 
 
510 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.218616  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0378  glycosyl transferase family protein  32.61 
 
 
342 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.799613 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2211  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 
357 aa  59.3  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276702  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1372  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 
633 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.371979  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 
373 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3225  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 
261 aa  53.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2284  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 
334 aa  52.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.911482 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5783  hypothetical protein  32.74 
 
 
318 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02310  glycosyl transferase  34.78 
 
 
354 aa  51.2  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2093  glycosyl transferase family 2  37.89 
 
 
282 aa  50.4  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
331 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2506  b-glycosyltransferase  26.12 
 
 
309 aa  49.7  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1910  glycosyl transferase family 2  31.13 
 
 
622 aa  49.7  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00799183  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  35.29 
 
 
281 aa  48.5  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1250  glycosyl transferase family protein  31.11 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.188831  normal  0.805856 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2202  glycosyl transferase protein  30.5 
 
 
256 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1905  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  31.63 
 
 
254 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1364  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  30.61 
 
 
254 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1660  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 
232 aa  47.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014309  hitchhiker  0.00126456 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 
349 aa  47.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1051  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  31.63 
 
 
254 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519037  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0817  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  31.63 
 
 
254 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1213  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.61 
 
 
254 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0334  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  31.63 
 
 
254 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.650997  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1408  glycosyl transferase family protein  32.41 
 
 
640 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  28.68 
 
 
322 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3730  glycosyl transferase family protein  27.71 
 
 
336 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.202885 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  31.09 
 
 
274 aa  47.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.57 
 
 
367 aa  47.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1204  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.61 
 
 
254 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 
319 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1404  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
280 aa  47.4  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189362  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0184  glycosyl transferase  23.53 
 
 
260 aa  47.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.397998  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0239  glucosyl transferase  23.53 
 
 
260 aa  47.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5387  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.31 
 
 
350 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2129  hypothetical protein  32.38 
 
 
289 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3499  glycosyl transferase family 2  40.51 
 
 
497 aa  46.6  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.802267  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0959  Cps2I  32.26 
 
 
306 aa  46.6  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2437  glycosyl transferase family 2  22.42 
 
 
357 aa  46.6  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3480  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 
261 aa  46.2  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 
663 aa  46.6  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3903  glycosyl transferase family 2  27.5 
 
 
369 aa  46.6  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1578  glycosyl transferase  27.52 
 
 
183 aa  46.2  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0848772  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1016  glycosyl transferase family protein  38.6 
 
 
231 aa  46.2  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.902573  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  30.25 
 
 
363 aa  46.2  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  31.09 
 
 
1120 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0302  glycosyl transferase family protein  38.6 
 
 
231 aa  46.2  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.82 
 
 
341 aa  45.8  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1612  glycosyl transferase family protein  38.6 
 
 
231 aa  45.8  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0968  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 
263 aa  45.8  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 
330 aa  45.8  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  30.08 
 
 
1157 aa  45.8  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4098  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  42.59 
 
 
1148 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 
247 aa  45.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0991  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  27.72 
 
 
254 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87113  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1203  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  27.73 
 
 
616 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.811759 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4162  hypothetical protein  28.48 
 
 
360 aa  45.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.6055  normal  0.532094 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2771  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  27.78 
 
 
269 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2949  glycosyl transferase family 2  28.93 
 
 
329 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2521  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
249 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.328172  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5418  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 
363 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348353  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1184  glycosyl transferase family protein  42.86 
 
 
801 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  32 
 
 
812 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1268  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.6355  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  48.98 
 
 
320 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1446  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 
280 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4932  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
274 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1461  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
233 aa  44.3  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.691252  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1158  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 
403 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5180  glycosyl transferase family 2  26.05 
 
 
322 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48188  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  33.93 
 
 
1032 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  38.46 
 
 
320 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  27.69 
 
 
1154 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0769  glycosyl transferase family protein  35 
 
 
297 aa  43.9  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2519  glycosyl transferase family protein  22.22 
 
 
257 aa  43.9  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0549  glycosyl transferase family protein  39.58 
 
 
243 aa  43.9  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.925315  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  32.22 
 
 
235 aa  44.3  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  34.78 
 
 
353 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0011  glycosyl transferase family 2  46 
 
 
291 aa  44.3  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000912491 
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.81 
 
 
351 aa  43.5  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001812  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  22.56 
 
 
255 aa  43.5  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.825658  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1493  glycosyl transferase family protein  27.72 
 
 
286 aa  43.5  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.948959 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2559  glycosyl transferase family 2  32.79 
 
 
754 aa  43.5  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 
348 aa  43.5  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0376  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 
267 aa  43.5  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0754  glycosyl transferase family 2  28.08 
 
 
341 aa  43.5  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.909004 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0632  glycosyl transferase family 2  25.53 
 
 
313 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138746  normal  0.982719 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3441  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.04 
 
 
311 aa  43.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49643  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2523  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 
249 aa  43.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.357373  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3180  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.36 
 
 
298 aa  42.7  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3908  glycosyl transferase family 2  24.21 
 
 
287 aa  42.7  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.078228  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2307  glycosyl transferase family protein  35.58 
 
 
360 aa  43.1  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4093  glycosyl transferase family 2  26.02 
 
 
257 aa  42.7  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0595  glycosyl transferase family protein  36.92 
 
 
402 aa  43.1  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  32.69 
 
 
330 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0769  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  25.47 
 
 
329 aa  42.7  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4606  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 
267 aa  42.7  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532863  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1230  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase KdtX  26.96 
 
 
231 aa  42.7  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3720  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 
974 aa  42.7  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>