189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3908 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3908  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
287 aa  596  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.078228  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2590  glycosyl transferase family 2  35.11 
 
 
310 aa  183  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.585939  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0252  glycosyl transferase family 2  36.56 
 
 
308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0566  glycosyl transferase family 2  32.97 
 
 
300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00277613  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2093  glycosyl transferase family 2  34.19 
 
 
282 aa  142  7e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3334  glycosyl transferase family protein  34.34 
 
 
292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3882  glycosyl transferase family 2  32.72 
 
 
295 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.395304 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3832  glycosyl transferase family 2  32.72 
 
 
295 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3875  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 
313 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0296583  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3040  glycosyl transferase family protein  33.21 
 
 
292 aa  123  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.679384  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1425  glycosyl transferase family 2  31.16 
 
 
310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1454  glycosyl transferase family 2  31.16 
 
 
310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1591  family 2 glycosyl transferase  31.14 
 
 
281 aa  115  6e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4532  family 2 glycosyl transferase  29.32 
 
 
313 aa  115  8.999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2546  glycosyl transferase family 2  32.31 
 
 
279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0274  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3434  glycosyl transferase family protein  28.04 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134306  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2749  glycosyl transferase family protein  31.29 
 
 
288 aa  113  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.989709  normal  0.0515771 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3181  glycosyl transferase family protein  29.54 
 
 
270 aa  112  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187841 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3266  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 
301 aa  109  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.987947  normal  0.0247911 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0374  glycosyl transferase family protein  28.73 
 
 
249 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0427  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.89 
 
 
293 aa  106  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161527  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18870  glycosyl transferase family 2  29.85 
 
 
257 aa  106  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0866305  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1166  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.91 
 
 
297 aa  103  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1077  putative glycosyltransferase  28.62 
 
 
276 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0850  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 
265 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.845126  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0370  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.52 
 
 
293 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.220444  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6295  glycosyl transferase family 2  27.72 
 
 
290 aa  99  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3379  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.44 
 
 
295 aa  98.2  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0084  glycosyl transferase family 2  27.24 
 
 
255 aa  94  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1301  glycosyl transferase family protein  26.33 
 
 
350 aa  92.4  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1446  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 
280 aa  90.9  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  25.47 
 
 
274 aa  88.2  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1549  glycosyl transferase family protein  26.82 
 
 
254 aa  87.4  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06130  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  27.05 
 
 
252 aa  87  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1248  glycosyl transferase family protein  28.04 
 
 
249 aa  86.7  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.480822  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3100  glycosyl transferase family 2  27.48 
 
 
247 aa  84  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2110  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.202375  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2254  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.23 
 
 
260 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.150124  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3929  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2052  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0681  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 
254 aa  79.7  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0206  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204479  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2921  glycosyl transferase family 2  27.08 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.417416 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0586  hypothetical protein  26.49 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2078  glycosyl transferase family protein  25.95 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149982  normal  0.0473511 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1246  glycosyl transferase family 2  24.52 
 
 
253 aa  79.3  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0609  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 
253 aa  78.2  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2344  beta-1,4-glucosyltransferase  25.1 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1130  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.33 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0782775  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0074  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.221966 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3480  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 
261 aa  77  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2523  glycosyl transferase family protein  24.33 
 
 
249 aa  76.6  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.357373  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3579  glycosyl transferase family 2  22.39 
 
 
272 aa  75.9  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28408  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2091  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 
260 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3225  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 
261 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5650  glycosyl transferase family protein  25.72 
 
 
250 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0756  glycosyl transferase family protein  25.82 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00258657  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1204  glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 
254 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0412  glycosyl transferase family 2  24.64 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1905  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  25 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1364  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  25 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2347  glycosyl transferase family protein  25.19 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1051  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  25 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519037  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0817  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  25 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1213  glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0334  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  25 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.650997  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00046  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  22.69 
 
 
255 aa  72.4  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  25.56 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2331  glycosyl transferase family protein  25.37 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.839622  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2202  glycosyl transferase protein  25.94 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1696  glycosyl transferase family protein  25.37 
 
 
250 aa  72  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792566  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2308  glycosyl transferase family protein  25.37 
 
 
250 aa  72  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1982  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 
256 aa  72  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2227  glycosyl transferase family protein  24.81 
 
 
250 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715035  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0896  b-glycosyltransferase  27.5 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000325648  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5794  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0376  glycosyl transferase family protein  32.37 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0883  hypothetical protein  27.6 
 
 
259 aa  70.5  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4093  glycosyl transferase family 2  23.72 
 
 
257 aa  70.5  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0852  hypothetical protein  27.6 
 
 
259 aa  70.1  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2519  glycosyl transferase family protein  23.77 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0291  UDP-glucose--lipooligosaccharide beta 1-4 glucosyltransferase  23.05 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0225943  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1277  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  23.97 
 
 
516 aa  69.3  0.00000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0664  putative glycosyltransferase  25.77 
 
 
253 aa  69.3  0.00000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0205038  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0775  glycosyl transferase family 2  24.91 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0605  b-glycosyltransferase  24.05 
 
 
254 aa  68.9  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2521  glycosyl transferase family protein  23.02 
 
 
249 aa  68.9  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.328172  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0862  glycosyl transferase family protein  25.29 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0588  glycosyl transferase family 2  34.71 
 
 
255 aa  68.6  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00392203  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1254  glycosyl transferase family 2  24.52 
 
 
253 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00808348  normal  0.786627 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1152  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  24.72 
 
 
515 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000783621  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1401  glycosyltransferase  24.12 
 
 
231 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.166634  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0867  glycosyl transferase family 2  24.29 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.177979  normal  0.126586 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1206  glycosyl transferase family protein  25.48 
 
 
521 aa  67.4  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.959652  normal  0.0123578 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1250  glycosyl transferase family protein  28.78 
 
 
270 aa  67  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.188831  normal  0.805856 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3291  putative LPS biosynthesis-related protein  24.52 
 
 
253 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.525684  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4606  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532863  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4963  glycosyl transferase family 2  27.37 
 
 
268 aa  65.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601362  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0011  glycosyl transferase family protein  27.86 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.360416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>