15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0402 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0402  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  677    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3140  hypothetical protein  46.69 
 
 		 340 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.999402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3412  hypothetical protein  46.06 
 
 		 340 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0018  hypothetical protein  39.55 
 
 		 328 aa  193  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0178486  normal  0.948027 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2294  hypothetical protein  39.12 
 
 		 341 aa  191  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0157947  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0220  hypothetical protein  35.84 
 
 		 336 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3579  hypothetical protein  37.05 
 
 		 338 aa  175  8e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.512655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0017  hypothetical protein  37.78 
 
 		 353 aa  168  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.129406  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2758  hypothetical protein  29.41 
 
 		 348 aa  129  7.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0413  hypothetical protein  31.99 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1859  hypothetical protein  27.67 
 
 		 323 aa  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.174959  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1056  hypothetical protein  32.98 
 
 		 416 aa  47.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496515  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0541  glycosyl transferase family protein  30.85 
 
 		 416 aa  45.8  0.0009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1197  hypothetical protein  31.96 
 
 		 320 aa  43.1  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.5811  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1512  hypothetical protein  27.35 
 
 		 303 aa  42.4  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>