12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1859 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1859  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  666    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.174959  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0413  hypothetical protein  38.51 
 
 		 362 aa  218  8.999999999999998e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3579  hypothetical protein  35.02 
 
 		 338 aa  161  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.512655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2294  hypothetical protein  33.44 
 
 		 341 aa  146  6e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0157947  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0018  hypothetical protein  31.51 
 
 		 328 aa  143  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0178486  normal  0.948027 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0220  hypothetical protein  30.91 
 
 		 336 aa  139  7e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2758  hypothetical protein  29.07 
 
 		 348 aa  132  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3140  hypothetical protein  33.45 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.999402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3412  hypothetical protein  32.53 
 
 		 340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0017  hypothetical protein  30.75 
 
 		 353 aa  125  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.129406  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0402  hypothetical protein  27.67 
 
 		 330 aa  103  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0031  glycosyl transferase family 2  32 
 
 		 636 aa  44.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.188799 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>