15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0017 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_0017  hypothetical protein  100 
 
 
353 aa  731    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.129406  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2294  hypothetical protein  48.8 
 
 
341 aa  311  6.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0157947  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0220  hypothetical protein  48.49 
 
 
336 aa  308  8e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0018  hypothetical protein  47.08 
 
 
328 aa  296  5e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0178486  normal  0.948027 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3579  hypothetical protein  48.57 
 
 
338 aa  292  5e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.512655  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3140  hypothetical protein  35.01 
 
 
340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.999402  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3412  hypothetical protein  36.39 
 
 
340 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0402  hypothetical protein  37.78 
 
 
330 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2758  hypothetical protein  31.71 
 
 
348 aa  159  6e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1859  hypothetical protein  30.75 
 
 
323 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.174959  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0413  hypothetical protein  29.67 
 
 
362 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4162  hypothetical protein  26.54 
 
 
360 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.6055  normal  0.532094 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2771  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  24.55 
 
 
269 aa  45.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2509  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 
408 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.790074 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1128  glycosyl transferase family 2  26.88 
 
 
414 aa  44.3  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>