28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3412 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3140  hypothetical protein  95.29 
 
 		 340 aa  677    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.999402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3412  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  705    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0402  hypothetical protein  46.06 
 
 		 330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2294  hypothetical protein  39.94 
 
 		 341 aa  235  8e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0157947  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0018  hypothetical protein  40.61 
 
 		 328 aa  219  5e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0178486  normal  0.948027 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0220  hypothetical protein  37.95 
 
 		 336 aa  202  8e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3579  hypothetical protein  36.19 
 
 		 338 aa  196  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.512655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0017  hypothetical protein  36.39 
 
 		 353 aa  182  7e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.129406  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2758  hypothetical protein  31.15 
 
 		 348 aa  132  7.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1859  hypothetical protein  32.53 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.174959  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0413  hypothetical protein  30.43 
 
 		 362 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4162  hypothetical protein  24.41 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.6055  normal  0.532094 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1056  hypothetical protein  31.45 
 
 		 416 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496515  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1773  hypothetical protein  28.43 
 
 		 787 aa  52  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.488982 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0541  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 		 416 aa  49.7  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2129  hypothetical protein  24.32 
 
 		 289 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1512  hypothetical protein  29.66 
 
 		 303 aa  46.6  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2771  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  31.11 
 
 		 269 aa  46.2  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0426  glycosyl transferase family 2  31.91 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2772  hypothetical protein  30.61 
 
 		 412 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.225588  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0382  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  30.65 
 
 		 844 aa  45.4  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.97387  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2490  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 		 344 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2211  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 		 357 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276702  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0347  glycosyl transferase family protein  30.85 
 
 		 260 aa  43.9  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.740125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0392  glycosyl transferase family 2  30.85 
 
 		 260 aa  43.9  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1409  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 585 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3923  protein of unknown function DUF23  28.57 
 
 		 286 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3846  hypothetical protein  31.76 
 
 		 302 aa  42.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.36073 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>