33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1512 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1512  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  635    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1521  hypothetical protein  31.23 
 
 		 278 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.807875  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0703  hypothetical protein  25.43 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.575877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3846  hypothetical protein  23.51 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.36073 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2953  hypothetical protein  37.5 
 
 		 328 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3179  hypothetical protein  37.5 
 
 		 328 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2606  hypothetical protein  23.64 
 
 		 328 aa  50.4  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0382  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  33.33 
 
 		 844 aa  50.1  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.97387  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1056  hypothetical protein  30.7 
 
 		 416 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496515  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0396  hypothetical protein  23.33 
 
 		 359 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3927  hypothetical protein  27.85 
 
 		 379 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.718732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5022  hypothetical protein  31.15 
 
 		 304 aa  47.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.841987 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3412  hypothetical protein  29.66 
 
 		 340 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2202  glycosyl transferase protein  32.43 
 
 		 256 aa  46.2  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0541  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 		 416 aa  45.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2307  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 360 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3140  hypothetical protein  27.35 
 
 		 340 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.999402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1177  putative glycosyl transferase  28.07 
 
 		 248 aa  44.3  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1602  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 		 248 aa  44.3  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.521644  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0413  hypothetical protein  34.34 
 
 		 362 aa  43.5  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5026  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 		 485 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4731  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 		 485 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4643  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 		 485 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1586  putative glycosyl transferase  28.16 
 
 		 248 aa  43.1  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2348  putative glycosyl transferase  27.12 
 
 		 251 aa  43.1  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1007  putative glycosyl transferase  28.16 
 
 		 248 aa  43.1  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2990  putative glycosyl transferase  27.59 
 
 		 248 aa  43.1  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000927401 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1372  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 		 633 aa  42.7  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.371979  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01961  predicted glycosyl transferase  27.01 
 
 		 248 aa  42.7  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01950  hypothetical protein  27.01 
 
 		 247 aa  42.7  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2771  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  31.19 
 
 		 269 aa  42.7  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0402  hypothetical protein  27.35 
 
 		 330 aa  42.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0018  hypothetical protein  29.59 
 
 		 328 aa  42.4  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0178486  normal  0.948027 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>