42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0382 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0382  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  100 
 
 		 844 aa  1738    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.97387  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1492  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  29.4 
 
 		 378 aa  174  6.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1770  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  29.4 
 
 		 378 aa  172  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1492  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  29.52 
 
 		 374 aa  160  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0925306  normal  0.0420453 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1812  hypothetical protein  26.98 
 
 		 379 aa  115  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1493  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  30.77 
 
 		 630 aa  106  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.21852  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3136  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  30.73 
 
 		 386 aa  88.2  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 		 3172 aa  85.1  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25.87 
 
 		 3301 aa  84.7  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4330  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.65 
 
 		 487 aa  78.2  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1814  hypothetical protein  28.86 
 
 		 362 aa  76.6  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.506376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  25.39 
 
 		 979 aa  75.1  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5188  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  23.83 
 
 		 423 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3255  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  22.9 
 
 		 407 aa  62.8  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.175633  normal  0.26995 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1205  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.27 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0430708  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5189  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.14 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2182  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  29.73 
 
 		 451 aa  59.3  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.400762  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4250  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  22.55 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.305989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1521  hypothetical protein  28.24 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.807875  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0099  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  24.3 
 
 		 351 aa  55.8  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0171907  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0626  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  23.89 
 
 		 366 aa  54.3  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1068  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  22.03 
 
 		 374 aa  53.9  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4682  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  20.78 
 
 		 414 aa  52  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00975  hypothetical protein  25.97 
 
 		 378 aa  52  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.480746  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4313  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  20.78 
 
 		 414 aa  51.6  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1512  hypothetical protein  33.33 
 
 		 303 aa  50.1  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1593  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  31 
 
 		 409 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0449  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  21.2 
 
 		 372 aa  49.3  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1485  hypothetical protein  43.4 
 
 		 392 aa  49.3  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0609062 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2370  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  24.87 
 
 		 373 aa  49.3  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0553875  normal  0.0113185 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3122  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.46 
 
 		 595 aa  49.3  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2606  hypothetical protein  25.3 
 
 		 328 aa  48.9  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1482  hypothetical protein  27.61 
 
 		 172 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122861 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5460  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  23.04 
 
 		 365 aa  47.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0253  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  22.6 
 
 		 368 aa  47.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0270966 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1193  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  21.65 
 
 		 505 aa  46.6  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2129  hypothetical protein  27.59 
 
 		 289 aa  46.6  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0427  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  21.35 
 
 		 372 aa  45.4  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182451  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3412  hypothetical protein  30.65 
 
 		 340 aa  45.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0161  hypothetical protein  29.85 
 
 		 349 aa  45.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4830  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  21.89 
 
 		 426 aa  45.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal  0.375609 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1774  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.89 
 
 		 377 aa  44.7  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.201895  normal  0.343819 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>