46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1068 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1068  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  100 
 
 		 374 aa  771    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2949  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  37.44 
 
 		 384 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5188  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  33.18 
 
 		 423 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  32.69 
 
 		 979 aa  88.2  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3098  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  30.17 
 
 		 418 aa  88.2  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4060  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  23.42 
 
 		 375 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5189  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  28.7 
 
 		 423 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 		 3301 aa  77.8  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 3172 aa  77.8  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3255  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  29.47 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.175633  normal  0.26995 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2370  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  31.98 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0553875  normal  0.0113185 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4250  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  31.98 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.305989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0161  hypothetical protein  28.45 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4387  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  36.94 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2023  hypothetical protein  28.16 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.426657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3136  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  22.08 
 
 		 386 aa  64.7  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2424  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  28.08 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.47686  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0427  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.22 
 
 		 372 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182451  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0626  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  23.91 
 
 		 366 aa  62  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0854  capsular polysaccharide biosynthesis protein  33.04 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0933972  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3662  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  27.51 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3663  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  28.19 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.87959 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_28422  predicted protein  27.71 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6880  hypothetical protein  34.86 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_28498  predicted protein  27.71 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6825  hypothetical protein  37.62 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.626132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3813  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0449  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.84 
 
 		 372 aa  56.2  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4313  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  32.54 
 
 		 414 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4830  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.76 
 
 		 426 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal  0.375609 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4682  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  32.54 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0991  hypothetical protein  28.08 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.569438  normal  0.641944 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0382  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  22.03 
 
 		 844 aa  53.9  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.97387  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3672  hypothetical protein  30.37 
 
 		 434 aa  53.9  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43765  normal  0.291983 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3122  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.76 
 
 		 595 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6306  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  24.56 
 
 		 350 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1287  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  28.86 
 
 		 493 aa  49.7  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0344  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  24.69 
 
 		 380 aa  48.9  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.422128  normal  0.156602 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4330  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  23.08 
 
 		 487 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1189  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.67 
 
 		 630 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.099685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1770  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.42 
 
 		 378 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  33.78 
 
 		 1213 aa  46.6  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1492  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.43 
 
 		 374 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0925306  normal  0.0420453 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47678  predicted protein  29.85 
 
 		 467 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1492  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.97 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50605  predicted protein  31.58 
 
 		 454 aa  43.9  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>