14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50605 on replicon NC_011700
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011700  PHATRDRAFT_50605  predicted protein  100 
 
 
454 aa  942    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44326  predicted protein  33.66 
 
 
448 aa  164  3e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.524343  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48697  predicted protein  33.44 
 
 
399 aa  154  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_28422  predicted protein  33.66 
 
 
306 aa  62  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_28498  predicted protein  33.66 
 
 
306 aa  62  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6825  hypothetical protein  36.56 
 
 
400 aa  60.1  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.626132  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0427  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  30.1 
 
 
372 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182451  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0854  capsular polysaccharide biosynthesis protein  30.87 
 
 
366 aa  52.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0933972  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0449  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  30 
 
 
372 aa  52.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6880  hypothetical protein  32.26 
 
 
383 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861416  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  28.89 
 
 
979 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36289  predicted protein  24.03 
 
 
514 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0634538  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1068  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  31.58 
 
 
374 aa  43.9  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2949  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  32.97 
 
 
384 aa  43.1  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>