27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_28498 on replicon NC_009372
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009372  OSTLU_28498  predicted protein  100 
 
 
306 aa  635    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_28422  predicted protein  100 
 
 
306 aa  635    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0854  capsular polysaccharide biosynthesis protein  33.01 
 
 
366 aa  63.2  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0933972  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50605  predicted protein  33.66 
 
 
454 aa  62  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44326  predicted protein  29.6 
 
 
448 aa  61.2  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.524343  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  35.05 
 
 
979 aa  59.3  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1068  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  27.71 
 
 
374 aa  58.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
3172 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
3301 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5188  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  33.88 
 
 
423 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36289  predicted protein  26.27 
 
 
514 aa  53.5  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0634538  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3136  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  30.56 
 
 
386 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0427  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.17 
 
 
372 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182451  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48697  predicted protein  24.68 
 
 
399 aa  50.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0449  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.09 
 
 
372 aa  49.3  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4387  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.78 
 
 
440 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3255  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  32 
 
 
407 aa  48.5  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.175633  normal  0.26995 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1287  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.52 
 
 
493 aa  47.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5189  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.88 
 
 
423 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4060  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  30.99 
 
 
375 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3098  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  27.93 
 
 
418 aa  46.2  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0161  hypothetical protein  30.77 
 
 
349 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3663  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  28.12 
 
 
398 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.87959 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4313  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.17 
 
 
414 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133022  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4682  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25 
 
 
414 aa  44.3  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148471  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6825  hypothetical protein  26.15 
 
 
400 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.626132  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06680  expressed protein  27.27 
 
 
461 aa  42.7  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.175779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>