58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4060 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4060  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  100 
 
 		 375 aa  765    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2949  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  31.58 
 
 		 384 aa  116  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2370  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  32.33 
 
 		 373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0553875  normal  0.0113185 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  28.78 
 
 		 979 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5189  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  29.96 
 
 		 423 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5188  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  31.38 
 
 		 423 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0854  capsular polysaccharide biosynthesis protein  31.95 
 
 		 366 aa  102  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0933972  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3255  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  28.38 
 
 		 407 aa  94.7  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.175633  normal  0.26995 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4250  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  30.61 
 
 		 398 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.305989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  32.5 
 
 		 3301 aa  92.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 3172 aa  92.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3136  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  30.41 
 
 		 386 aa  92.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1068  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  24.06 
 
 		 374 aa  90.9  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3663  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  23.71 
 
 		 398 aa  82  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.87959 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0626  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  33.53 
 
 		 366 aa  78.6  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3662  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  25.2 
 
 		 381 aa  78.2  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3122  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  24.84 
 
 		 595 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4387  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  35.19 
 
 		 440 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0427  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.51 
 
 		 372 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182451  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3098  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  24 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2424  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  27.6 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.47686  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6306  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.29 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1287  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.8 
 
 		 493 aa  73.9  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0449  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.52 
 
 		 372 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4682  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.79 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0161  hypothetical protein  29.19 
 
 		 349 aa  72  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4830  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.69 
 
 		 426 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal  0.375609 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4313  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.89 
 
 		 414 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1493  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.3 
 
 		 630 aa  68.9  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.21852  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5945  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.48 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01531  hypothetical protein  24.74 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0344  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  41.89 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.422128  normal  0.156602 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3672  hypothetical protein  25.24 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43765  normal  0.291983 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1193  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  28.71 
 
 		 505 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2023  hypothetical protein  30.21 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.426657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1189  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.02 
 
 		 630 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.099685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  24.81 
 
 		 1213 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6880  hypothetical protein  28.57 
 
 		 383 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6825  hypothetical protein  26.58 
 
 		 400 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.626132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3813  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  26 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1205  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.16 
 
 		 338 aa  62  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0430708  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1812  hypothetical protein  24.36 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47678  predicted protein  32.09 
 
 		 467 aa  54.3  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4330  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  31.03 
 
 		 487 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1492  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25 
 
 		 378 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4960  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  35.29 
 
 		 399 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1770  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25 
 
 		 378 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0099  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  23.17 
 
 		 351 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0171907  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1814  hypothetical protein  24.62 
 
 		 362 aa  51.2  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.506376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1492  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  24.57 
 
 		 374 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0925306  normal  0.0420453 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1593  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.05 
 
 		 409 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3001  hypothetical protein  23.03 
 
 		 521 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489823 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_28498  predicted protein  26.13 
 
 		 306 aa  47  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_28422  predicted protein  26.13 
 
 		 306 aa  47  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2182  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  27.09 
 
 		 451 aa  47  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.400762  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6689  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.73 
 
 		 391 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0382  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  22.65 
 
 		 844 aa  44.3  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.97387  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50605  predicted protein  23.93 
 
 		 454 aa  44.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>